Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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JC JC | NC_000913 | 1,606,148 | IS2 (+) +5 bp | coding (49‑53/876 nt) | lsrF → | 3‑hydroxy‑2,4‑pentadione 5‑phosphate thiolase |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 1606148 = | 0 (0.000) | coding (49/876 nt) | lsrF | 3‑hydroxy‑2,4‑pentadione 5‑phosphate thiolase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 64 (0.690) | 48/502 | 0.7 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1606152 | 0 (0.000) | coding (53/876 nt) | lsrF | 3‑hydroxy‑2,4‑pentadione 5‑phosphate thiolase |
AATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTATTGTCGTTAGTGGTGAGTCGTCGGTATATCTGAATGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCA > NC_000913/1467636‑1468176 | aaTGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTATTGTCGTTAGTGGTGAGTCGTCGGTATATCTGAATGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCt > 2:752427/1‑275 (MQ=255) aaTGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTATTGTCGTTAGTGGTGAGTCGTCGGTATATCTGAATGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCt > 1:340253/1‑275 (MQ=255) tggtggACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTATTGTCGTTAGTGGTGAGTCGTCGGTATATCTGAATGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTgg > 1:446801/1‑275 (MQ=255) tggtggACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTACTTGCGCAAAGGATATAGTTCTACCCGCGTTAATGTGGTTAGTGGTGAGTCGCCTGTATGTCTGAAGGGAGGTACGACAATCACCGCACAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAATCTTTGCCGGATATTGGCATTGGCGCTACGCTAACAATCCGGGATATTGCCAGTTTTGAACATACTGGGACAAGAACCCTgg > 2:588884/1‑275 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |