| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 1,606,148 | IS2 (+) +5 bp | coding (49‑53/876 nt) | lsrF → | 3‑hydroxy‑2,4‑pentadione 5‑phosphate thiolase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 1606148 = | 0 (0.000) | coding (49/876 nt) | lsrF | 3‑hydroxy‑2,4‑pentadione 5‑phosphate thiolase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 64 (0.690) | 48/502 | 0.7 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1606152 | 0 (0.000) | coding (53/876 nt) | lsrF | 3‑hydroxy‑2,4‑pentadione 5‑phosphate thiolase | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
ATGTCGCGGATGCATTATTGAAAAAAGGATCAATGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTACCCTGAAAGGTTGCGGTGCGCTGGATTGGGGAATGCAGTCACGCTTATCGCGGATATTTAATCCGAAAACGGGTAAAACCGTGATGCTGGCTTTTGACCATGGTTATTTTCAGGGACCGACTACCGGACTTGAACGCATTGATATAAATATCGCCCCGCTGTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAATAGGCCGGTGGTACTGCGG > NC_000913/1605880‑1606420 | ttgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAAACGc > 1:529989‑M2/269‑275 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |