| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1825935 | 28 (0.870) | 8 (0.270) | 8/236 | 2.0 | 23.0% | intergenic (‑310/+20) | spy/astE | periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase |
| ? | NC_000913 | = 1825939 | 28 (0.960) | intergenic (‑314/+16) | spy/astE | periplasmic ATP‑independent protein refolding chaperone, stress‑induced/succinylglutamate desuccinylase | |||||
AGAGTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTCGAGCATTAATCCCGCGCGTAATCCCAACGCTACCAACGGATTAGGGAATAACACATACTCTACATCATGGGTTACGGTAAAACGTTCCTCTCCGTCCTGCGCCAGCAAT > NC_000913/1825797‑1826078 | agagTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATttctgc > 4:81807‑M2/1‑143 (MQ=255) gagTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATttctgc < 1:153042‑M2/148‑7 (MQ=255) gagTGATGAGAGAATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATttctgc > 2:153042‑M2/1‑142 (MQ=255) agagaATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATt < 6:157948‑M2/135‑2 (MQ=255) agagaATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATt > 5:157948‑M2/1‑134 (MQ=255) gagaATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAAatcaatctgcggg > 5:35480‑M1/1‑129 (MQ=255) gagaATATTACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAAatcaatctgcggg < 6:35480‑M1/142‑14 (MQ=255) ttACAACACGATGATTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCtt < 4:132254/148‑1 (MQ=255) gatgatTTTGCAGAGATTATGAAGAACTATACCGGATGACTGGTGATAAATAAAGCAAATAACCAGGATTAATCTGTATTAATTTATAAGAAAGCAACTTAATACCCGCAGAATGATTTCTGCGGGTAAGTATTAGCTTATTTTTTc > 5:120567/1‑147 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |