| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4345941 = | 108 (1.160) | 4 (0.040) | 4/260 | NT | 3.5% | coding (1386/1647 nt) | fumB | anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B) |
| ? | NC_000913 | 4345963 = | 113 (1.230) | coding (1364/1647 nt) | fumB | anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B) | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CTTCCATACCCAGCTCCGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGA > NC_000913/4345793‑4346086 | cggtaaagaacttccgcagtacatcaaagatcacccgatctactacgcgggtccggcgaaaacccctgccggttatccatcaggttcacttggcccaaccaccgcaggccgtatggactcctacgtggatctgctgcaatcccacggcg < 1:116910‑M1/2‑1 (MQ=255) cATACCCAGCTCCGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGAGGCGCCCGAGGTAGAAGCCGCCGTGGTTATGCCGCGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGc > 4:359753/1‑147 (MQ=255) tACACAGCTCCGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTATATGACACGCGTCGGTAACCAGCTGACTGCGCTTACCTTTCGCCAg > 4:292859/1‑148 (MQ=255) cccAGCTCCGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCAt > 7:327298/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCCGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCTGTTACCTTTCGCCAGCAt > 3:346128/1‑148 (MQ=255) ccAGCTCCGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCAt > 8:182989/1‑148 (MQ=255) cAGCTCCGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGa < 7:366682/149‑1 (MQ=255) ccGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCAtg > 1:124294/1‑149 (MQ=255) tatgCGTCGCACTCCAGATGCTTGTTGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCGGGTCCGCCGATTCTACCGAGGTAGATGCCGGCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGAGTGCGGTTACGTTTCGCGAGGATGATCAtgctggc < 6:255634/146‑3 (MQ=255) tAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTgcc < 8:188814/149‑1 (MQ=255) gCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTgccgcc > 3:164562/1‑149 (MQ=255) gCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCG‑CAGCATGATCATGCTGccgccg > 1:347886/1‑149 (MQ=255) gACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGt > 3:270312/1‑149 (MQ=255) cGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTgg < 5:326409/149‑1 (MQ=255) 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aTGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTgca > 5:90598/1‑146 (MQ=255) gCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGTGATTgcag > 8:399592/1‑145 (MQ=255) cTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGa < 4:276554/148‑1 (MQ=255) cTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGAt < 6:113780/149‑1 (MQ=255) ttGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAATCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATc > 5:389175/1‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) tgctgACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCgtag > 3:349984/1‑147 (MQ=255) ctgACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAg > 2:311186/1‑67 (MQ=255) ctgACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAg < 1:311186/67‑1 (MQ=255) gACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCgtag > 6:42860/1‑143 (MQ=255) cTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCgg < 7:147219/149‑1 (MQ=255) cTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCgg > 6:142539/1‑149 (MQ=255) cTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCgg < 6:405138/149‑1 (MQ=255) gCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGt > 5:64025/1‑149 (MQ=255) cGGTTACCTTTCGCCAGCCGGATCATGCTGCCGCCGTGGGAGTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCggg < 4:75577/147‑1 (MQ=255) cGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCggg < 1:52227/147‑1 (MQ=255) ggTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCgg < 1:157540/78‑1 (MQ=255) ggTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCgg > 2:157540/1‑78 (MQ=255) gTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGAT‑ACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATc < 6:381038/149‑1 (MQ=255) ccTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCtt < 3:68600/148‑1 (MQ=255) cTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCttt > 5:397168/1‑148 (MQ=255) cTTTCGCCAGCATGAGCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGGTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTg < 5:230980/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGa < 7:133064/147‑1 (MQ=255) | CTTCCATACCCAGCTCCGGATAAGCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGA > NC_000913/4345793‑4346086 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |