New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4345941 = | 108 (1.160) | 4 (0.040) | 4/260 | NT | 3.5% | coding (1386/1647 nt) | fumB | anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B) |
? | NC_000913 | 4345963 = | 113 (1.230) | coding (1364/1647 nt) | fumB | anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B) | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTGCGGAAGTTCTTTACCGGC > NC_000913/4345816‑4346111 | gCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTgccgcc > 3:164562/1‑149 (MQ=255) gCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCG‑CAGCATGATCATGCTGccgccg > 1:347886/1‑149 (MQ=255) cGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTgg < 5:326409/149‑1 (MQ=255) gCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTgg > 1:102978/1‑148 (MQ=255) atcacccgatctactacgcgggtccggcgaaaacccctgccggttatccatcaggttcacttggcccaaccaccgcaggccgtatggactcctacgtggatctgctgcaatcccacggCGCCAGCATGATCATGCTgccgcc < 7:235942‑M1/24‑1 (MQ=255) aCTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGAt > 3:208972/1‑149 (MQ=255) aCTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGAt < 4:208972/149‑1 (MQ=255) cAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGCCTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTg > 3:75577/1‑147 (MQ=255) cAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTgca < 4:270312/149‑1 (MQ=255) cAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTgca < 3:145367/149‑1 (MQ=255) cAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTgc < 1:212801/148‑1 (MQ=255) cAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCAGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGAGGGATTg > 7:326314/1‑147 (MQ=255) aGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTgcag > 8:236121/1‑149 (MQ=255) gATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTgcagc < 2:204527/149‑1 (MQ=255) gATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTgcag > 1:204527/1‑148 (MQ=255) aTGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTgcagca < 4:16508/149‑1 (MQ=255) gCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGTGATTgcag > 8:399592/1‑145 (MQ=255) cTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGAt < 6:113780/149‑1 (MQ=255) 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tctGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGGTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAg > 3:327799/1‑149 (MQ=255) tgctgcGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAg < 7:163582/147‑1 (MQ=255) ctgcGCCAGTACCGCCGCCGGAGCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCAGTGTTTATGACACGCGTCGTTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGGAGATCCACGTAGGa < 3:292859/147‑1 (MQ=255) gcCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCa > 8:282001/1‑148 (MQ=255) gTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACgg > 5:405138/1‑149 (MQ=255) 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ccgccgGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATTACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTAACCTTTCTCCAGCATGATCATGCTCCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCAAACGGCCTGCg > 2:126290/1‑149 (MQ=37) ccgccgGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCg < 3:30553/149‑1 (MQ=255) ccgccgGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGACGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCg < 3:184076/149‑1 (MQ=255) cgccgGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCgg > 8:190467/1‑149 (MQ=255) cgGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCggtgg < 1:30148/149‑1 (MQ=255) 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ggcggcagcatgatcatgctggcgCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGAt < 7:235942‑M2/118‑1 (MQ=255) ggcggcagcatgatcatgctggcgCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGAt > 8:235942‑M2/25‑142 (MQ=255) tCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGa < 7:133064/147‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGa < 1:331948/147‑1 (MQ=255) gCCAGCATGATCATGCTGCCGCGGTGGGATTGCAGCATATCGACGTAGGAGTCGATACGGCCTTCGGTGGTTGTGACAAGTGTTTCTGATTGATATCTGGCAGTGGTTTTATACTGACCCGCGTTGTTGATCGGGTGATCTTTGATGt < 4:346128/148‑1 (MQ=255) aGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTg < 2:124294/149‑1 (MQ=255) cATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCaa > 1:112469/1‑74 (MQ=255) gATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAg > 4:94399/1‑95 (MQ=255) gATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAg < 3:94399/95‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTGCGGAAGTTc < 5:359264/149‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTGCGGAAGTTc > 3:85744/1‑149 (MQ=255) tgctgcCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTGCGGAAGTTCt < 4:85744/149‑1 (MQ=255) ctgcCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTGCGGAAGTTCtt > 2:116910/1‑148 (MQ=255) cgCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTGCGGAAGTTCTTTACCg < 1:116910‑M2/147‑1 (MQ=255) ccgTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGGGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTGCGGAAGGTCTTTACCGGc < 1:220626/149‑1 (MQ=255) | GCGACGCACTCCAGATGCTTGATGCTCTGCTGCGCCAGTACCGCCGCCGGACCGCCGATGCTACCGAGGTAGAAGCCGCCGTGTTTATGACACGCGTCGGTAACCTGCTGACTGCGGTTACCTTTCGCCAGCATGATCATGCTGCCGCCGTGGGATTGCAGCAGATCCACGTAGGAGTCCATACGGCCTGCGGTGGTTGGGCCAAGTGAACCTGATGGATAACCGGCAGGGGTTTTCGCCGGACCCGCGTAGTAGATCGGGTGATCTTTGATGTACTGCGGAAGTTCTTTACCGGC > NC_000913/4345816‑4346111 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |