| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,867,796 | IS1 (+) +9 bp | 22.9% | coding (950‑958/1140 nt) | nlpD ← | activator of AmiC murein hydrolase activity, lipoprotein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 13 (0.140) | 12/266 | NT | 18.3% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2867804 | 54 (0.640) | coding (950/1140 nt) | nlpD | activator of AmiC murein hydrolase activity, lipoprotein | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2867796 = | 54 (0.640) | 19 (0.210) | 18/266 | NT | 24.7% | coding (958/1140 nt) | nlpD | activator of AmiC murein hydrolase activity, lipoprotein |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
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GATTTCCCCTTGTAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTT > NC_000913/2867648‑2867944 | ttgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAt > 8:382984‑M1/147‑149 (MQ=255) ccccTTGTAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTAt > 7:344572/1‑149 (MQ=255) cTTGTAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGtt > 3:149226/1‑149 (MQ=255) cTTGTAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGtt < 3:246646/149‑1 (MQ=255) tAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTtgat > 5:255009/1‑149 (MQ=255) tAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTtgat > 5:3961/1‑149 (MQ=255) tAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCACGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTtgat > 3:277134/1‑149 (MQ=255) tAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCACGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTtgat < 4:277134/149‑1 (MQ=255) aaacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagttgcatgacaaagtcatcgggcaatatctgaacataaaacactaacaataagttggagtcattaccCATTATGTTtgat < 1:148702‑M1/13‑1 (MQ=255) aCGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTggtga > 5:315351‑M2/1‑143 (MQ=255) gAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTtgat < 1:107094/145‑1 (MQ=255) aaTTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGTCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATaa < 7:297822/149‑1 (MQ=255) aaaaTGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCATGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGAt < 5:98566/149‑1 (MQ=255) aaaaTGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGATATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTggtgatgctgccaa > 1:221276‑M2/1‑134 (MQ=255) aggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTa > 6:352686‑M1/124‑149 (MQ=255) gCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCg > 8:72126/1‑149 (MQ=255) gCAAGCGTGTTGAACTCGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCg > 1:127303/1‑149 (MQ=255) aGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAg < 4:172639/149‑1 (MQ=255) aGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAg < 6:3961/149‑1 (MQ=255) gtgtTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCcg > 3:223405/1‑149 (MQ=255) ctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCcg < 4:345590‑M1/35‑1 (MQ=255) tgtTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCcgc > 5:139061/1‑149 (MQ=255) tGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGGCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCa < 8:131089/149‑1 (MQ=255) aaCTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAgc > 7:89587/1‑149 (MQ=255) gTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATg > 7:348175/1‑110 (MQ=255) gTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATg < 8:348175/110‑1 (MQ=255) ttCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggt < 7:43068‑M2/149‑39 (MQ=255) gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTAc > 4:218844‑M1/102‑149 (MQ=255) cGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTAcc < 8:324462/148‑1 (MQ=255) 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aTGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAaacaac > 5:110684/1‑149 (MQ=255) gTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAAcgcg > 3:328539/1‑149 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCgg < 4:367886‑M1/65‑1 (MQ=255) gCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGc > 6:267664/1‑148 (MQ=255) tcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTa < 8:22496‑M1/47‑1 (MQ=255) tcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTa > 7:22496‑M1/82‑128 (MQ=255) tATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCAt > 5:18656/1‑149 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATc < 5:311458‑M1/70‑1 (MQ=255) ttttttGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGTCTTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtactccagtggctt > 4:157998‑M2/1‑87 (MQ=255) ttttttGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCAt < 8:69530/147‑1 (MQ=255) ttttGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGc > 2:217801/1‑149 (MQ=255) tGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt > 8:43068‑M2/1‑82 (MQ=255) cccGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga < 3:382933‑M2/125‑47 (MQ=255) cccGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 4:382933‑M2/1‑79 (MQ=255) cTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATaa > 5:18130/1‑149 (MQ=255) ttAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAAt > 1:290267/1‑149 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATaa > 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cATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTGGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGatat < 6:224478/149‑1 (MQ=255) ttGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGc < 8:383728/124‑1 (MQ=255) ttGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGc > 7:383728/1‑124 (MQ=255) ttGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCa < 6:110684/149‑1 (MQ=255) gTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCt < 6:18130/149‑1 (MQ=255) gTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCt > 2:406784/1‑149 (MQ=255) gTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGAGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCt > 3:303897/1‑149 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCt > 2:324775‑M1/30‑149 (MQ=255) actatcaataagttggagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCttgt > 7:125951‑M1/27‑149 (MQ=255) tGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCttgtt < 3:385356/149‑1 (MQ=255) tGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCttgt < 3:259489/148‑1 (MQ=255) tGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCttgt < 1:357220/148‑1 (MQ=255) tGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCAACATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCttgtt > 8:304600/1‑149 (MQ=255) gggCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCttgtt < 4:223405/148‑1 (MQ=255) ggCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTggtgaggctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttagaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacgg > 5:27598‑M2/1‑32 (MQ=255) gCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCGGCGATATCAATCCCCTTGTTGcc > 1:352528/1‑149 (MQ=255) cTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAg > 1:5819/1‑148 (MQ=255) tCAGGTAATCATCATTATGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccc > 7:142031‑M2/1‑21 (MQ=255) tCAGGTAATCATCATTATGTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccc < 8:142031‑M2/103‑83 (MQ=255) tCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAAcg < 8:282473/74‑1 (MQ=255) tCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAAcg > 7:282473/1‑74 (MQ=255) gagtcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCATTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAGaa > 3:345590‑M1/12‑148 (MQ=255) tcattaccCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGTCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAGAAgcgc > 2:148702‑M1/9‑149 (MQ=255) tcatcaTTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAGAAGCGCCaaa < 1:91210/149‑1 (MQ=255) tcatcaTTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAGAAGCGCCa > 5:49674/1‑147 (MQ=255) tcatcaTTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGAGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCCCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAGAAGCGCCa > 3:137892/1‑147 (MQ=255) atcatTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCAACTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTATGCTGCCTGCGATATCACTCCCCTTGTTGCCCACCACAGCAGCGCCAAAgc > 2:271925/1‑148 (MQ=255) catTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGtt > 3:115043/1‑149 (MQ=255) | GATTTCCCCTTGTAACGAATTTCAAAATGCAAGCGTGTTGAACTGGTTCCGGTGCTACCCATGGTCGCTATTTTTTGCCCCGCCTTAACTTCTTGTTGTTCCCGGACCAGCATTGTGTCGTTATGGGCGTAGGCACTCAGGTAATCATCATTATGTTTGATGATAATCAGATTACCGTAGCCGCGCAGCGCGTTACCAGCATAAACAACGCGGCCATCTGCGGTCGCGATAATTGCCTGTCCTTTGCTGCCTGCGATATCAATCCCCTTGTTGCCCCCCTCAGAAGCGCCAAAGGTT > NC_000913/2867648‑2867944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |