Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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JC JC | NC_000913 | 2,099,835 | IS1 (+) +8 bp | intergenic (‑222/+20) | ugd ← / ← gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 2099835 = | 0 (0.000) | 134 (1.130) | 95/278 | 0.1 | 100% | intergenic (‑222/+27) | ugd/gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGT > NC_000913/2099688‑2099983 | gCTACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAAAAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCt > 8:44390/1‑149 (MQ=255) tACGTTGTTCGATGGTCAACGTAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTc > 3:304564/1‑148 (MQ=255) tACGTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTc > 2:387821/1‑148 (MQ=255) gttgttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAAtt < 5:56347/149‑1 (MQ=255) ttgttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAAttt > 6:2414/1‑149 (MQ=255) gcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTa > 6:59190‑M1/140‑149 (MQ=255) gcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTa < 4:342855‑M1/10‑1 (MQ=255) gcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaaggcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTa > 6:158679‑M1/140‑149 (MQ=255) gTTCTATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTg > 3:372391‑M2/1‑147 (MQ=255) gTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTg > 4:183869‑M2/1‑147 (MQ=255) ttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggt > 8:293862‑M2/1‑146 (MQ=255) ttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTgg > 8:34989‑M2/1‑146 (MQ=255) gATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgat < 4:430806‑M2/149‑7 (MQ=255) 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ctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCa > 8:190850‑M1/115‑149 (MQ=255) aTTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggt > 6:487439‑M2/1‑120 (MQ=255) cAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCt > 5:283809/1‑111 (MQ=255) cggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCAtt > 7:502595‑M1/109‑149 (MQ=255) aGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatg > 6:87019‑M2/1‑116 (MQ=255) gATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 3:198362‑M2/1‑115 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6:468153‑M1/126‑1 (MQ=255) cccGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc > 7:441945‑M2/1‑30 (MQ=255) aataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTgg > 3:481327‑M1/21‑132 (MQ=255) ggTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaa > 7:359548‑M2/1‑27 (MQ=255) tggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAAcag < 7:270213‑M1/134‑1 (MQ=255) tcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCgca > 2:255484‑M1/9‑132 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |