| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,099,835 | IS1 (+) +8 bp | intergenic (‑222/+20) | ugd ← / ← gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 111 (0.930) | 79/280 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2099842 | 0 (0.000) | intergenic (‑229/+20) | ugd/gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2099835 = | 0 (0.000) | 134 (1.130) | 95/278 | 0.1 | 100% | intergenic (‑222/+27) | ugd/gnd | UDP‑glucose 6‑dehydrogenase/6‑phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
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TTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAA > NC_000913/2099694‑2099988 | gcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTa > 6:59190‑M1/140‑149 (MQ=255) gcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaaggcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTa > 6:158679‑M1/140‑149 (MQ=255) ttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTgg > 5:176751‑M2/1‑146 (MQ=255) ttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTgg > 6:418536‑M2/1‑146 (MQ=255) cGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtg > 2:143981‑M2/1‑144 (MQ=255) tCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgc < 3:245539‑M2/149‑12 (MQ=255) aatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGtt < 3:451265‑M1/19‑1 (MQ=255) aggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCa > 8:360526‑M1/124‑148 (MQ=255) 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ctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCa > 3:342855‑M1/115‑149 (MQ=255) aTTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggt < 5:487439‑M2/123‑4 (MQ=255) ttCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgt > 6:304309‑M2/1‑119 (MQ=255) tCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgta < 8:205168‑M2/149‑32 (MQ=255) cggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCAtt > 7:502595‑M1/109‑149 (MQ=255) 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ggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTa > 1:149869‑M1/103‑148 (MQ=255) tataAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt > 8:371154‑M2/1‑106 (MQ=255) ggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGaa < 6:253691‑M1/51‑1 (MQ=255) taAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt > 7:87550‑M2/1‑104 (MQ=255) aaGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg > 5:330142‑M2/1‑103 (MQ=255) 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5:402720‑M2/149‑145 (MQ=255) aaTTTggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgc > 6:166998‑M2/1‑5 (MQ=255) ttttATTGTTGGTTAAATCAGATTTATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTaa > 4:235640/1‑149 (MQ=255) ttttATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTaa < 1:61072/149‑1 (MQ=255) ttttATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTaa > 4:335309/1‑149 (MQ=255) ttttATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTaa < 6:268945/149‑1 (MQ=255) | TTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTATCAATACGCTTATAAGTATGCGCACCAAAATAGTCACGCTGTGCCTGGATCAGGTTCGCAGGCAGAACAGCAGCACGGTAGCTGTCGTAA > NC_000913/2099694‑2099988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |