| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,368,899 | IS2 (–) +5 bp | coding (1073‑1077/1128 nt) | yhcG → | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 36 (1.010) | 29/262 | 0.4 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3368899 = | 0 (0.000) | coding (1073/1128 nt) | yhcG | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3187426 | NA (NA) | 33 (0.920) | 25/262 | 0.6 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3368903 | 0 (0.000) | coding (1077/1128 nt) | yhcG | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily | |||||
GAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTA > NC_000913/3185960‑3186226 | gAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGccccc > 3:64853/1‑149 (MQ=255) aTCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCt < 3:30856/145‑1 (MQ=255) aTCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCt > 4:30856/1‑145 (MQ=255) gCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAAtctc > 5:167693/1‑149 (MQ=255) cATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTcc < 7:4605/149‑1 (MQ=255) tGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGa < 4:64853/148‑1 (MQ=255) ttCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAata < 8:102902/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCa > 1:97342/1‑149 (MQ=255) ccACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGccccc < 8:39928/119‑1 (MQ=255) ccACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTaaa < 2:97342/149‑1 (MQ=255) acaTCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAata > 2:124741/1‑138 (MQ=255) acaTCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAata < 1:124741/138‑1 (MQ=255) atcatTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGttatta > 7:5824/1‑104 (MQ=255) atcatTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGttatta < 8:5824/104‑1 (MQ=255) atTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTTTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTTAATCTCCAGACAACCAATATCACTTTAATAAGTGa < 6:167693/149‑1 (MQ=255) gTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAat < 2:52323/113‑1 (MQ=255) gTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGtttt > 4:6962/1‑149 (MQ=255) tGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGttttt < 3:6962/149‑1 (MQ=255) gATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTaa < 4:64885/131‑1 (MQ=255) aaaattaaaattAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTg > 5:62271/1‑146 (MQ=255) ttaaaattacCCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGaa > 3:21977/1‑147 (MQ=255) ttaaaattaaCCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTATTTAAGTGATattggt < 4:61524/116‑6 (MQ=255) ttaaaattaaCCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTATTTAAGTGATattggt > 3:61524/1‑111 (MQ=255) ttGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCg > 5:140257/1‑147 (MQ=255) ttGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGga < 6:140257/149‑1 (MQ=255) aTTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGgaga > 1:59982/1‑148 (MQ=255) ttAAAAACATTTATGGTTCATTATCCGTTATTAGCCTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATCGATGTCTTAGGGCCGGAGaaa < 4:21977/149‑1 (MQ=255) aaaaaTATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAAc < 2:59982/148‑1 (MQ=255) aaaTATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCaa > 4:89541/1‑59 (MQ=255) aaaTATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCaa < 3:89541/59‑1 (MQ=255) ttattGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGc > 7:41898/1‑149 (MQ=255) ttGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTa > 8:133013/1‑149 (MQ=255) ttCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGtttt > 4:90624/1‑84 (MQ=255) ttCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGtttt < 3:90624/84‑1 (MQ=255) tCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGgag < 6:118629/123‑1 (MQ=35) tCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGgag > 5:118629/1‑123 (MQ=35) gTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGga < 3:35749/119‑1 (MQ=33) gTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGga > 4:35749/1‑119 (MQ=33) ttattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACa < 6:48785/94‑1 (MQ=33) ttattaGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACa > 5:48785/1‑94 (MQ=33) | GAGTAATCGCATTTGGCCGGGTTCGCCCGGCCACATCATTAACGGATTAATGATAAGTGGATCAGATGTATAAAAAATTAAAATTAACCACAATAAGCGAATTGATTAAAAATATTTATTGTTCATTATCCGTTATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTA > NC_000913/3185960‑3186226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |