| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 52.4% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 26 (0.480) | 25 (0.440) | 21/412 | NT | 48.3% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 24 (0.440) | 30 (0.540) | 23/410 | NT | 54.8% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
CGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGG > NC_000913/458568‑459020 | acctccccccgtgcccgtaagccagccccagacgtcgcatagttgcagcctcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtaccgaagtagccagttcgtcgggcttaccaatatgggccaaaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACa > 1:636961‑M1/224‑229 (MQ=255)acatccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACa > 1:566417‑M1/224‑229 (MQ=255)acatccccccggggcattaagccagccccagacgtagcgcagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACa > 2:162820‑M1/224‑229 (MQ=255) gATACCATGGACAGTCTGCCGTTCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtc < 2:354162‑M1/229‑3 (MQ=255) tGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACACTTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTTATTTCTCGGCGTTGAATTTGGGGGAAACAtcccataaa > 2:559031‑M1/1‑220 (MQ=255) 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> 2:540366‑M1/213‑228 (MQ=255) ggccgtaagccaggcccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATCCCCATATACt > 1:515915‑M1/212‑229 (MQ=255) tGCCGTCCGTGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATC‑GACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaactt < 1:579461‑M1/229‑19 (MQ=255) tGCCGGCCATGGAAGACGTCAAAAAAGTGGTTATCGGAGGAG‑CGGTTATTGATGGTTAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaactt < 2:208682‑M1/229‑19 (MQ=255) 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2:678670‑M1/1‑43 (MQ=255) ttaTTTTTCCTCTAATCTCGGGGTTGGATGTGGGGGAAACATCCCCATATAATGACGTACATGTTAAAAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTTAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCCGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTcggg < 1:727699/227‑1 (MQ=255) cgaaatatcccaacccgtaagttaggctgtatgggAAAACATCCCCAGAGTCTGACGTTCATGTTAAGAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATGACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGAATTGAAATCCCCGTATTGCCTCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTcggg > 2:693799‑M1/36‑229 (MQ=255) tttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccaattttgttattctccacaacgagttagttcttcttttcgg > 1:663322‑M1/1‑36 (MQ=255) 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1:247065‑M1/1‑22 (MQ=255) tGAATGTGGGGGAAACAtcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagatgaccatttttgttattctccacaacgagttagttcttcttttcggatccggcacttctggggggga > 1:140452‑M1/1‑17 (MQ=255) gcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAGTGGGTGGTTTATCCGCACAGGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAACTCTATCCGTTGTCTg < 2:297708‑M1/218‑1 (MQ=255) gcgcttatgggGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAGGTGGTGGCTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGCTGGGCGGGAAAAATCTAGCCGTTGGCTg < 1:512110‑M1/218‑1 (MQ=255) 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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |