Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | NC_000913 | 2,023,796 | Δ5 bp | 71.2% | intergenic (+118/‑168) | fliR → / → rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2023801 = | 28 (0.240) | 68 (0.610) | 46/486 | NT | 71.2% | intergenic (+123/‑167) | fliR/rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis |
? | NC_000913 | = 2023795 | 28 (0.250) | intergenic (+117/‑173) | fliR/rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis |
TGGCAAGGTCATCAACGGTTTCAATGTCGTTGATTTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCAACAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2024088‑2023801 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaagtaaaTGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGGCCATAC < NC_000913/2023795‑2023509 TGGCAAGGTCATCAACGGTTTCAATGTCGTTGATTTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCAACAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCTACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTCTAATTTCTCTGGCATCTGTCTTttataacc > 1:475989/1‑281 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GTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACG < 2:1057581/289‑1 CATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAAT < 2:927158/288‑1 GCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGG < 1:557106/221‑1 GCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGG > 2:557106/1‑221 CATACCCTCACTCAATGCGTACCCATAATTCCCCTTACCTGATTATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTATTGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCCGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGTAATTATATT < 1:999664/289‑1 CACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATTCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTA < 1:888268/269‑1 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AACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAA > 2:678868/1‑289 AACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAAT > 2:409679/1‑219 AACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAAT < 1:409679/219‑1 AACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATCTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGAAAA > 2:349789/1‑289 GTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAAT > 2:369806/1‑289 CACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTA < 1:464236/289‑1 ACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTA > 1:72330/1‑288 CACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCA > 2:450952/1‑246 CACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCA < 1:450952/246‑1 agtttatgGATTTGTCAGGCGTACTTAATATCCAGTAAAGTGTTGGATAATTTGACTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAAGGTTGCGATATTTTGGTGAGCTTAAAAGAAATATTTCGCTGCAGAAGTATCCTGGAATATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCATTAAGATAACATGATAAACGTTACGAAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAAGTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAATAGTTGCAATTAACGGCATTAATGC < 2:541169/281‑1 TCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCC > 1:462574/1‑289 GGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAAATGCCGA < 1:27919/289‑1 CTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAG < 2:72330/289‑1 TACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTC < 1:1028636/289‑1 CCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTG < 1:224304/238‑1 CCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTG > 2:224304/1‑238 CCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCA < 2:875304/213‑1 CCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCA > 1:875304/1‑213 GTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTA < 1:679577/154‑1 GTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTA > 2:679577/1‑154 TTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGACGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCATCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCAATTAAAGAGATTCCGACAGTCAGATGTCATGGAAATCC > 1:840403/1‑289 TATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTCATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTCATGGAAATCCAAT > 1:324196/1‑289 TGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGCTGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATACTCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGATGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTAAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAA > 1:1041294/1‑289 AAGTAAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGG > 2:166325/1‑288 AAATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGGCCATA < 1:988068/289‑1 AATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATACACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATACTTGCGGGGCCATAC > 2:850979/1‑289 AATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGGCCATAC > 2:662951/1‑289 AATGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGGCCATAC > 1:328166/1‑289 TGGCAAGGTCATCAACGGTTTCAATGTCGTTGATTTCTCTTTTTTTAACCCCTCTACTCAACAGATACCCGGTTAAACCTAGTCGGGTGTAACTACATAAATCCATAATAATCGTTGACATGGCATACCCTCACTCAATGCGTAACGATAATTCCCCTTACCTGAATATTTCATCATGACTAAACGGAACAACATGGGTCACCTAATGCGCCACTCTCGCGATTTTTCAGGCGGACTTACTATCCCGTAAAGTGTTGTATAATTTGCCTGGAAT‑TGTCTTAAAGTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2024088‑2023801 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaagtaaaTGTTGCGATATGTGAGTGAGCTTAAAACAAATATTTCGCTGCAGGAGTATCCTGGAAGATGTTCGTAGGTATTATTTTTCGGATAATCCTTAGGATAACATGATAAACGTTACGGAATTATATTAATGGCAATTCACTAATAATATCAGCCAGCAAATTAAAAATTTCACTGAATAAATGTTCGCAAAAAGGTGCAATTAACGGCATTAATGCCGCCATTAAAGAGATGCCGACAGTCAGAGTTAATGGAAATCCAATAACAAAAATGGATAATTGCGGGGCCATAC < NC_000913/2023795‑2023509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |