| Predicted mutation | |||||||
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| JC | NC_000913 | 2,023,796 | Δ5 bp | 71.2% | intergenic (+118/‑168) | fliR → / → rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 2023795 | 28 (0.250) | intergenic (+117/‑173) | fliR/rcsA | flagellar export pore protein/transcriptional regulator of colanic acid capsular biosynthesis | |||||
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GTATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACCTACGAACATCTTCCAGGATACTCCTGCAGCGAAATATTTGTTTTAAGCTCACTCACATATCGCAACATTTACTTTACTTTAAGACAATTCCAGGCAAATTATACAACACTTTACGGGATAGTAAGTCCGCCTGAAAAATCGCGAGAGTGGCGCATTAGGTGACCCATGTTGTTCCGTTTAGTCATGATGAAATATTCAGGTAAGGGGAATTATCGTTACGCATTGAGTGAGGGTATGCCATGTCAACGATTATTATGGATTTATGTAGTTACACCCGACTAGGTTTAACCGGGTATCTGTTGAGTAGAGGGGTT‑AAAAAAAGAGAAATCAACGACATTGAAACCGTTGAT > NC_000913/2023509‑2024078 | gTATGGCCCCGCAATTATCCATTTTTGTTATTGGATTTCCATTAACTCTGACTGTCGGCATCTCTTTAATGGCGGCATTAATGCCGTTAATTGCACCTTTTTGCGAACATTTATTCAGTGAAATTTTTAATTTGCTGGCTGATATTATTAGTGAATTGCCATTAATATAATTCCGTAACGTTTATCATGTTATCCTAAGGATTATCCGAAAAATAATACCTACGAACATCTTCCAGGATACTCCTGCAGCGAAATATTTGTTTTAAGCTCACTCACATATCGCAACAtt > 2:662951‑M2/1‑287 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |