| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3270593 = | 90 (0.530) | 3 (0.020) | 3/492 | NT | 3.4% | intergenic (‑1/+32) | rnpB/garK | RNase P, M1 RNA component/glycerate kinase I |
| ? | NC_000913 | 3270621 = | 83 (0.500) | intergenic (‑29/+4) | rnpB/garK | RNase P, M1 RNA component/glycerate kinase I | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CTTGCTCCGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAAGACCGCATCAATGCCATGCTGATGTAC‑AACGCCAACATCATCGGTCAGGCTACCCGCAATGCCAATCACCGGTTTATGGTACTTCTTCGCCACGTTTGCGACACCAATCGGTACCTTCCCGTGAATACTCTGGCTGTCAATACGCCCTTCACCGGTGATCAC > NC_000913/3270343‑3270909 | ttcacgggaaggtaccgattggtgtcgcaaacgtggcgaagaagtaccataaaccggtgattggcattgcgggtagcctgaccgatgatgttggcgttgtacatcagcatggcattgatgcggtcttcagcgtattgaccagcataggtacgttggacgaagcattccgcggggcttatgacaatatctgccgtgcttcacgtaatatcgccgcgacactggcgattggaatgcgcaacgcggggtgacaagggcgcgcaaaccctctatactgcgcgccCTTGTCAcc < 1:1496825‑M2/9‑1 (MQ=255) ccGGGTGGAGTTTACCGTGCCACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTg < 1:1013212/289‑1 (MQ=255) ccACGGACTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAgtg > 1:66234/1‑289 (MQ=255) cTGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCgcgg < 1:971191/288‑1 (MQ=255) tGTTACCAGCCGCGCGTTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCgcggcg < 1:1036227/289‑1 (MQ=255) tGTTACCAGCCGCGCGGTGCGCGCTTACCGCCCCCTTTCACTCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCgcggcg < 1:114961/289‑1 (MQ=255) aCCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTcg > 1:595364/1‑280 (MQ=255) aCCAGCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTcg < 2:595364/280‑1 (MQ=255) gCCGCGCGGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCCTTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACg > 1:1521948/1‑289 (MQ=255) cgcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTTTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGCGCCCGGACTTTCCTCCCCACCGCCCGCCTCCCCCGTAGA‑GGACGACGACGAAGCTG‑CGACTGTCCGGTCAGCTTCGTCTCGCAGTACAGAGGACTTTCGCGCCTTTCTCATCGCGCCGTTCGTTTCTCAATCGCCAGGCTCTCGCCGatactcctccaa > 2:662956/1‑280 (MQ=255) cgcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGaa > 1:933900/1‑289 (MQ=255) cgcgGTGCGCTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGGATAGCGGGTTTGCCCGCCCTTTCCACCCCGCGTTGCGCTTTCCAATCCCCAGTGTCGCGGCGATATTTGGTGac > 2:822097/1‑288 (MQ=255) gcTCTTACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGc < 1:169480/288‑1 (MQ=255) tACCGCACCCTTTCACCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGatat > 1:208445/1‑289 (MQ=255) aCCCTTTCCCCCCTCCCTGTTCCCGCTTGGGCGGGCCATCGGCGGGTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTGCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCGGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCAt < 2:1521948/289‑1 (MQ=255) ttCCCCCTTACCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGcc < 2:792118/289‑1 (MQ=255) ccTTTCCCGCTCCCGCTTGCGCGGGCCAACGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCCCTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCCCCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCcgcg < 2:1150156/289‑1 (MQ=255) aCCTGATCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTT‑CCCACCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTCTAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGGGTCGCGGCGAAATTACTTGAAGCACGGCAGATTTTTTCCTAAGCCCCGCGTAATg > 2:361300/1‑289 (MQ=255) tCCCGCTTGCGCGGGCCATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTCCGTGAAGCACGGCCGATATTGTCATAAGCCCAGCGGAATGCTTCg > 1:514757/1‑289 (MQ=255) gtggccgaccgctgggcggTTTTCGCTGTTTTGCACTTGGAGTGGGTTTCCCCCCCGTGCGTTACCGGGCCCCCTGCCCTTTGGAGCCCGGACTTGCCTCCCCTCCGCCCGGCTCCCCCGAAGA‑GGACGAGGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATATAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGGGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCaa < 2:793043/274‑1 (MQ=255) ccATCGGCGGTTTGCTCTCTGTTGCACTAGTCGTGGGTTT‑CCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATg < 1:361300/288‑1 (MQ=255) tCGGCGGTTTGCGCTCGGGTGCACTGGGCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCGCGGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCTG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGATGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTg < 2:323553/289‑1 (MQ=255) tttGCGCTGGTCGTGGGCTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGGCTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGAGTGTCTGGTCAGCGTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTGGCGCGCCCTTGTCACCCCTCGTTGCGCATTCCAAGCGCCAGTGTCACGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAAGAc < 1:245942/288‑1 (MQ=255) gTTGCACTGGTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTAACTGGCACCCTGCCCTATAGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGAGG‑CGACTGTCTGGTACGCTTCGGCGCGCAGTACAGAGGGCTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATCCCAATCGCCAGCGTCGCGGCGCTAATACGTGAAGGACGGCAGATAGTGTCATACGCCACGCGGAATGCTACTTCCAACGTACCTATGCCGATTCATACGCTGAAGa > 2:1329031/1‑288 (MQ=255) gTCGTGGGTTTCCCCCCCAGGCGTTACCTGGCACCCTGCCCTATGGAGCCCGGACTTTCCTCCCCTCCGCCCGTCTCCCCCGAAGA‑GGACGACGACGAAGCGG‑CGACTGTCTGGTCAGCTTCGGCGCGCAGTATAGAGGGTTTGCGCGCCCTTGTCACCCCGCGTTGCGCATTCCAATCGCCAGTGTCGCGGCGATATTACGTGAAGCACGGCAGATATTGTCATAAGCCCCGCGGAATGCTTCGTCCAACGTACCTATGCTGGTCAATACGCTGAAGACCGCATCAAt > 1:269503/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |