Predicted mutation | |||||||
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JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 81.2% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 458790 = | 14 (0.180) | 62 (0.770) | 43/418 | NT | 81.1% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 458795 | 14 (0.180) | 59 (0.740) | 48/416 | NT | 80.4% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GCCACTCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGT‑GAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGT > NC_000913/607775‑608243 | gCCACTCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGT‑GAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCCTa > 1:629946/1‑239 (MQ=255) ccACTCCAAACCCGGACAGTTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCATTGCGGCAGTCATAGTGCAGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCGTCTGGTCGGGACCTCGCGCTGT‑GAGTTTACGGTGAAGGGAAGGAATCTTTAGCTTCAGGCTGGTTCCGCCTCCGCACGCAAACAGTAGCCCTTGTGGGGGGGGGAATCCCTTaa > 2:1070226/1‑239 (MQ=255) tgcAAACCCGAACAATTGGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATAGAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGT‑GAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc < 1:474381/237‑1 (MQ=255) tCCAAACCCTAACAATTTGGATGGTTGTCCCTTTGTCGCATGGAGGAAATATAACTATGCTGCCGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCTTAGTGCTGTGTTTAGCGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGT‑GAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc < 2:754049/239‑1 (MQ=255) 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aaCAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGT‑GAGTTTACGGTGCAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGCAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGTGTAATCCCATAACCGCTAACTTAAgg > 1:619863/1‑239 (MQ=255) aaCAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGT‑GAGTTTACGGGGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTTTCGCTTCCGAACCGAAGAAGTAGCCGTTTTGCGGGGAGGAATCCCTTAAGCGCTACATTAAgg > 1:804734/1‑239 (MQ=255) aCAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTGTTTAACGGTGCTGGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGT‑GAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGTGCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAggg < 1:754782/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |