New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4177445 | 158 (1.140) | 3 (0.020) | 3/418 | NT | 2.0% | coding (88/384 nt) | secE | preprotein translocase membrane subunit |
? | NC_000913 | = 4177614 | 135 (1.000) | coding (257/384 nt) | secE | preprotein translocase membrane subunit | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
TGGCTCATCAGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGAT > NC_000913/4177207‑4177677 | tGGCTCATCAGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGA < 1:467936‑M1/239‑1 (MQ=255) tGGCTCATCAGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGA > 2:57936‑M1/1‑239 (MQ=255) ggCTCATCAGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGCAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGTCAGGTTGGTTTATGAGTGCGATTACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGAAGAAGTGGGTCGTTGGGGGTGCATTGCTCCTGGTGGCGAt > 2:621696/1‑239 (MQ=255) gCTCATCAGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGAtt > 2:313957/1‑239 (MQ=255) tcatcaGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGt < 2:768476/239‑1 (MQ=255) tcaGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCg > 2:200152/1‑238 (MQ=255) caGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGc < 2:264728/239‑1 (MQ=255) aGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCa < 2:244085/239‑1 (MQ=255) gATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCa < 2:536662/236‑1 (MQ=255) cTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCttt > 1:334265/1‑239 (MQ=255) 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gAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGc < 1:873352/239‑1 (MQ=255) gggCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCg > 1:1464678/1‑239 (MQ=255) gggCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCg > 2:788936/1‑239 (MQ=255) 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cgcgTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCggg < 1:43570/239‑1 (MQ=255) gTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGggtgg > 2:711373/1‑239 (MQ=255) tttCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCtgcgtgcg < 1:1235659/203‑1 (MQ=255) ttCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGAttgtcggccaaatgaccttacggacttcggtacgcgcttcacgggcaaaagcaacggtagctttaccttttgtcgttaacagc < 1:1321467‑M1/238‑84 (MQ=255) gATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTcg < 2:1236536/239‑1 (MQ=255) tttGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTcgcg < 2:461600/239‑1 (MQ=255) ggTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGAgtcggccaaatgaccttacggacttcggtacgcgcttcacgggcaaaagcaacg < 1:419533‑M1/201‑55 (MQ=255) 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ggttTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGaa < 1:365034/239‑1 (MQ=255) ggttTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGaa < 2:30193/239‑1 (MQ=255) gCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAgg > 2:438909/1‑238 (MQ=255) 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aTGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCAcacca < 1:97012/232‑1 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGAt > 1:683388/1‑239 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGAt > 2:147284/1‑239 (MQ=255) 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cGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACCCCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCCCTGAt > 2:1103598/1‑235 (MQ=255) | TGGCTCATCAGTGATTTTCTTTGTCATAATCATTGCTGAGACAGGCTCTGTTGAGGGCGTATAATCCGAAAAGCTAATACGCGTTTCGATTTGGTTTGCCTCGCGATCGCGGGGTGAAAATGTTTGTAGAAAACTTCTGACAGGTTGGTTTATGAGTGCGAATACCGAAGCTCAAGGAAGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGAT > NC_000913/4177207‑4177677 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |