| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4177445 | 158 (1.140) | 3 (0.020) | 3/418 | NT | 2.0% | coding (88/384 nt) | secE | preprotein translocase membrane subunit |
| ? | NC_000913 | = 4177614 | 135 (1.000) | coding (257/384 nt) | secE | preprotein translocase membrane subunit | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
AGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCTTTATCACTGGCCTGAGGTTCTGAGATGTCTGAAGCTCCTAAAAAGCGCTGGTACGTCGTTCAGGCGTTTTCCGGTTTTGAAGGCCGCGTAGCAACGTCGCTGCGTGAGCATATCAAATTACACAACATGGAAGA > NC_000913/4177385‑4177852 | aGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAgg < 1:771262/238‑1 (MQ=255)aGCGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAgg < 1:1260176/238‑1 (MQ=255) cGGGCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGaa > 2:1335279/1‑238 (MQ=255) gggCGCGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGaaa < 2:923227/238‑1 (MQ=255) gcgcGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACa < 1:10935/238‑1 (MQ=255) gcgcGGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACAt > 1:584874/1‑239 (MQ=255) cgcgGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGCAACAtt > 1:499766/1‑239 (MQ=255) gcgGCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACAtt < 1:1162336/238‑1 (MQ=255) gcgGCCGGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCCTTGCCCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGCCATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACAtt < 2:1165634/238‑1 (MQ=255) gtcTGGAGGCTATGAAGTGGGTCGGTGTGGTGGCATTGCGCCTGGTGGCAGTGGTCGGCAAGTATATGTGTCGCGGCCTTATGAGGCCGATGCGTGCGCTGGCTGTAGTTATTCTGATTGGTGCAGCGGGTGGTCTCGCGCTTTTAACGACAAAAGGTAAAGCTATCGTTGCTTTTGCACGTAAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGca < 2:1316365/236‑1 (MQ=255) gCCTGGAAGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGca < 1:717378/238‑1 (MQ=255) aGCGATGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACg < 1:24001/238‑1 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAgg > 1:1155076/1‑217 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCAcacca > 2:97012/1‑232 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGAt > 1:683388/1‑239 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGAt > 2:147284/1‑239 (MQ=255) aTGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGAt > 2:737477/1‑239 (MQ=255) tGAAGTGGGTCGTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGAt < 1:434871/238‑1 (MQ=255) gTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGt < 2:685575/239‑1 (MQ=255) gTTGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGt < 1:313957/239‑1 (MQ=255) ttGTGGTGGCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGtt > 2:382490/1‑239 (MQ=255) gtggCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGc > 1:90395/1‑239 (MQ=255) ggCATTGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAg < 1:729035/239‑1 (MQ=255) ttGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTCCCGCAGTAAt > 2:879768/1‑239 (MQ=255) ttGCTCCTGGTGGCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAAt < 2:304315/239‑1 (MQ=255) tggCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCGCGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGAt < 2:1189129/238‑1 (MQ=255) tggCGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGAt < 1:164245/238‑1 (MQ=255) cGATTGTCGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGAt > 2:156859/1‑235 (MQ=255) 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cGGCAACTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGa < 1:1205110/238‑1 (MQ=255) cGGCAACTAGCTTATTCGCGACATGATGCGGCCGCTGCGGGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGa < 2:1186353/238‑1 (MQ=255) aaCTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGa < 1:682154/239‑1 (MQ=255) aaCTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGa < 1:1024063/239‑1 (MQ=255) aaCTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGa < 1:200152/239‑1 (MQ=255) aaCTATCTTTATCGCGACATTATGCTGCCGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGa < 1:488431/239‑1 (MQ=255) 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cGCTGCGTGCGCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCtt < 2:227293/238‑1 (MQ=255) tgcgCTGGCCGTAGTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCTTTATCACTg > 2:787355/1‑239 (MQ=255) tGGCCGTGTTAATTCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCTTTATCACTGGCCTg < 2:41252/239‑1 (MQ=255) 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1:524674/1‑187 (MQ=255) ttCTGATTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCTTTATCACTGGCCTGAGGTTCTGAGAt > 2:658837/1‑239 (MQ=255) aTTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTg > 1:233484/1‑201 (MQ=255) aTTGCTGCAGCGGGTGGTGTCGCGCTGTTAACGACAAAAGGTAAAGCTACCGTTGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCTTTATCACTGGCCTGGGGTTTTGAGATGTcgg > 2:1317418/1‑237 (MQ=255) 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tGCTTTTGCCCGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCTTTATCACTGGCCTGAGGTTCTGAGATGTCTGAAGCTCCTAAAAAGCGCTGGTACGTCGTTCAGGCGTTTTCCGGTTTTGAAgg < 1:1008516/238‑1 (MQ=255) ccGTGAAGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCTTTATCACTGGCCTGAGGTTCTGAGATGTCTGAAGCTCCTAAAAAGCGCTGGTACGTCGTTCAGGCGTTTTCCGGTTTTGAAGGCCGCGTAGCa < 1:333185/239‑1 (MQ=255) aGCGCGTACCGAAGTCCGTAAGGTCATTTGGCCGACTCGCCAGGAAACATTGCACACCACGCTGATTGTGGCTGCGGTTACCGCAGTAATGTCACTGATCCTGTGGGGACTGGATGGTATTCTGGTTCGCCTGGTATCCTTTATCACTGGCCTGAGGTTCTGAGATGTCTGAAGCTCCTAAAAAGCGCTGGTACGTCGTTCAGGCGTTTTCCGGTTTTGAAGGCCGCGTAGCAACGTCg < 2:886374/239‑1 (MQ=255) 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NC_000913/4177385‑4177852 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |