| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3100618 = | 210 (1.350) | 3 (0.020) | 3/418 | NT | 1.4% | coding (111/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 |
| ? | NC_000913 | 3100639 = | 206 (1.360) | coding (90/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGA > NC_000913/3100381‑3100856 | ttttatgccgtttaattcttcgttttgttacctgcctctaactttgtagatctccaaaatatattcacgttgtaaattgtttaacgtcaaatttcccatacagagctaagggataatgcgtagcgttcacgtaactggaggaatgaaatggagtttttcaaaaagacggcacttgccgcactggttatgggttttagtggtgcagcattggcattacccaatatcaccattttagcaa < 2:934787‑M1/1‑1 (MQ=255) tttaattcttcgttttgttacctacctctaactttgtagatctccaaaatatattcaagttgtaaattgtttaacgtcacatttcccatacagagctaagggataatgcgtagcgttcacgaaactggaggactgaaatggcgtttttcaaaaagacggtccttgccgcactggttatgggtgttggtggcgcagcattggcattacccaagatcaccattttagcaaccgtcggcacc < 2:741219‑M1/12‑9 (MQ=255) gTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:1002730/1‑238 (MQ=255) gTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 1:1259425/1‑238 (MQ=255) tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCCCCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:1413763/1‑237 (MQ=255) tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:1653656/1‑237 (MQ=255) aaTGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTaaaa < 1:1395156/239‑1 (MQ=255) aCGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCCCCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 2:490252/238‑1 (MQ=255) aGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGata < 1:689386/239‑1 (MQ=255) tCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACTACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTggg > 2:637850/1‑239 (MQ=255) tCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGC‑ATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGt > 2:427062/1‑239 (MQ=255) cGGTCTTATCGTAGTGGGTTTTAATTTTTTTCCCCATTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGt < 2:1154576/239‑1 (MQ=255) cGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGt < 2:1637579/239‑1 (MQ=255) 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aaTTTTTTACGCCAGTGCCGGCCAGACATTATCGTTCATGTCCCGGGTGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAGCTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTaa < 2:315504/239‑1 (MQ=255) tttttCGCCTGTGCCGCCCAGACATTATCGTGCATGTCCTGGGAGCCGATATTCCCTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTATTTGCGGCCCCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTCCCCACTGTGTATTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTTGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAAcc < 2:1034066/239‑1 (MQ=255) tttCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCa > 2:1559466/1‑239 (MQ=255) 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TTCTTCCATCGTGTCGGTACCGTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGA > NC_000913/3100381‑3100856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |