| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3100618 = | 210 (1.350) | 3 (0.020) | 3/418 | NT | 1.4% | coding (111/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 |
| ? | NC_000913 | 3100639 = | 206 (1.360) | coding (90/1047 nt) | ansB | periplasmic L‑asparaginase 2 | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAA > NC_000913/3100402‑3100875 | gTGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:1002730/1‑238 (MQ=255) tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCCCCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:1413763/1‑237 (MQ=255) tGGGTAATGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGtt > 2:781072/1‑237 (MQ=255) aaTGACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTaaaa < 1:1395156/239‑1 (MQ=255) gACGAGGCCGTCGGTCTTATGTCAGTCGATGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGCCATTATCGTTCATGCCCTGGTAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTCCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCGCCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCGCCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 2:66560/239‑1 (MQ=255) gACGAAGCCGTCGGTTTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTCCCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTCCCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCGCCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 2:1070078/239‑1 (MQ=255) gACGAAGCCGTCGGTCTTATCGCAGTCGGTGTTAATTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTCCCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATgg < 1:879467/239‑1 (MQ=255) 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aaTTTTTTTCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTaa < 2:963014/239‑1 (MQ=255) tttCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCa > 1:805317/1‑239 (MQ=255) tttCGCCAGTGTCAGCCAGACATTATCGTTCATGTCCTGGGAGCCGATATTCACTACCTGCTCGCCTTTAACGTTCGCAATGTCTTTTAGTTGCGGCACCGCATTAACCAGATTTTCTACGCCAACTTTACCCACTGTGTAGTTAGATTTGGTTGCGGAGTCACCACCACCGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCa > 2:1559466/1‑239 (MQ=255) 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2:863583‑M1/195‑1 (MQ=255) CGGCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACg < 2:83616‑M1/236‑1 (MQ=255) GCAATGGTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACgaagaa < 1:1390341‑M1/239‑1 (MQ=255) ggTCCCGCCGGTTGCTAAAATGGTGATATTGGGTAATGCCAATGCTGCACCACTAAAACCCATAACCAGTGCGGCAAGTGCCGTCTTTTTGAAAAACTCCATTTCATTCCTCCAGTTACGTGAACGCTACGCATTATCCCTTAGCTCTGTATGGGAAATTTGACGTTAAACAATTTACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTaaa < 1:679640/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |