| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | 272376 = | 169 (0.970) | 140 (0.810) +CT |
118/492 | 0.5 | 44.8% | intergenic (+8/‑16) | CYL77_01365/CYL77_01370 | aspartate kinase/aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
| ? | CP025533 | 2085498 = | 179 (1.030) | intergenic (‑47/+5) | CYL77_09945/CYL77_09950 | thymidylate synthase (FAD)/4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CGGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP025533/272623‑272376‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTCG > CP025533/2085498‑2085743 || CGGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTC < 2:501008/249‑1CGGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTC < 1:458406/249‑1 GGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCT < 2:201741/249‑1 GGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCT < 1:610312/249‑1 GTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTA < 1:499207/249‑1 GCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGC < 1:314187/249‑1 CTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCT < 2:601353/249‑1 CTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCT > 1:625074/1‑249 AGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTAC > 1:328163/1‑249 GCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACA < 2:967687/249‑1 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CGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTC > 2:1104772/1‑249 GTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCA > 2:1014899/1‑249 GTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACATGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCA < 1:1338232/249‑1 TCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAn > 2:1550924/1‑248 TCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAA < 2:156871/249‑1 TCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGGCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAn > 2:667264/1‑248 TGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCC < 2:1118030/249‑1 TGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCC > 1:1259635/1‑249 TCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTA < 2:363067/249‑1 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nACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCC < 1:831740/248‑1 TACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCC > 2:875757/1‑249 ACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCA > 2:612438/1‑249 nCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCA < 1:702737/248‑1 nCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCA < 1:240445/248‑1 ATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGA > 1:291475/1‑249 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TTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGTTCAATGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGAT > 2:655043/1‑249 TTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGAT > 2:1601109/1‑249 GCCTGTGAAACGTGTGTACGCAAAGACACGAACAGTGTCAGCTGAGAAAGTGCGCTCTTCCAAAAGGTTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTTCGATGGTGTTCATTTTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAG < 2:154899/249‑1 GGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCC < 1:1515115/249‑1 AAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGT < 1:1002917/249‑1 CGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGAC > 2:1493908/1‑249 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AGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGAGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACAGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACAGGGTGCAAATAAGTTCCGACCATAGGAGTCCACATTGATGGTAAAGGTCTGACACTagctccca > 2:1446964/1‑241 TTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTT < 1:849939/249‑1 TTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTT < 2:755436/249‑1 GCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGC > 2:219023/1‑249 nCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGT < 2:36420/248‑1 CAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCA < 1:637966/249‑1 CAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGACTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACTCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCA > 2:481870/1‑249 AAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGCGCAAC > 2:1637/1‑249 GGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACTAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATG < 2:1468158/249‑1 GCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGA > 2:1408620/1‑249 CATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGAC > 1:774715/1‑249 TAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGGTAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACAT > 2:1323942/1‑249 ACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGC > 1:1043354/1‑249 ACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGC < 2:947799/249‑1 CTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGG > 1:818686/1‑249 GCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACT > 2:678797/1‑249 CGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGC < 2:562308/249‑1 GACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCA > 1:673119/1‑249 CTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGA > 2:730482/1‑249 nGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAA < 2:106784/248‑1 nGGCCGGTAGCACCAAAAATTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTCCTCCTTCTATCCTTTACAGGCCTAGGGAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAA < 2:328163/248‑1 TGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAA > 2:312950/1‑249 TTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGAT < 2:291475/249‑1 TTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGAT < 2:831074/249‑1 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CGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGC < 1:68555/249‑1 GATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCG < 2:702433/249‑1 GTGGTCATTGTAAAACTGCTCCTGCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCAC < 1:1115230/249‑1 GTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGG > 1:11430/1‑249 GTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGG < 2:25917/249‑1 ATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGACCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGGGCAACCATGCCGGACATGCGGTCTGCGTGAACCGGGACTCCATCTACGCTTGCGCCGCGGGAgc > 2:1097433/1‑247 TGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCC > 2:1472494/1‑249 ACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGT > 1:1331649/1‑249 CTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTG > 2:1247001/1‑249 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TCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTCG < 1:778443/249‑1 TCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTCG < 2:1259635/249‑1 TCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTCG > 2:1224669/1‑249 || CGGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP025533/272623‑272376‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTCG > CP025533/2085498‑2085743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |