| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 1044917 | 2 (0.010) | 165 (0.960) +TT |
135/492 | 0.1 | 66.5% | intergenic (+340/+110) | CYL77_05015/CYL77_05020 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | CP025533 | = 2084621 | 166 (0.960) | intergenic (‑123/+78) | dapA/CYL77_09945 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/thymidylate synthase (FAD) | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GTGAGTTCTTGGGCACCTGTCATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/1044670‑1044917‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCC‑AA‑ATGAGGGAAGAAGGTAACCTTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCAATGGTTACTCCATTCACGGAATCCGGAGACATCGATATCGCTGCTGGCCGCGAAGTCGCGG < CP025533/2084621‑2084378 || GTGAGTTCTTGGGCACCTGTCATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAAT < 2:230593/249‑1 CCTGTCATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGT < 1:764307/249‑1 nGTCATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCA < 1:1017451/248‑1 TGTCATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTTTCAAAGGAACGCTTGAACGCGCGATAAATGTGGGGTTGAGACCACAGCGAACCCGATTTTTGACGCTCCTTGGTTTGAATATGCACTGCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCTACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTCCCATAGGCGAATTCATCTTGCTCGAGTCA > 2:723060/1‑249 GTCATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAA > 2:1409392/1‑249 TCATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTTGTGTCcct > 2:1332699/1‑246 CATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATT < 1:486375/249‑1 CATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATT < 1:1149363/249‑1 ATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTT > 2:1070064/1‑249 TCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTC < 2:1459509/249‑1 AAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGA > 2:846058/1‑249 gatggGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACATTACAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAACACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATG < 2:530821/244‑1 GACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATG < 2:1013900/249‑1 CGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTT < 1:110235/249‑1 GTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACTCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTG > 1:736696/1‑249 TGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGG > 2:1083445/1‑249 AGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTTCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATT < 1:1489486/249‑1 CTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTA < 2:1252896/249‑1 nnTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATG < 1:1143700/247‑1 nTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGC < 2:130853/248‑1 TTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCA < 1:1461711/249‑1 GGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAA < 1:1458899/249‑1 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TCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTG > 1:594335/1‑249 CAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGC > 2:156778/1‑249 ACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGG < 1:1573772/249‑1 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AGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCT < 2:650358/249‑1 CCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAG < 2:319717/249‑1 CCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGCTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAG > 1:934978/1‑249 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CACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTG > 1:227823/1‑249 ACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGG < 1:1063351/249‑1 CCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCA > 1:637700/1‑249 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CATACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCAATGGTTACTCCATTCACGGAATCCGGAGACATCGATATCGCTGCTGGCCGCGA > 2:792478/1‑249 ACGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCAATGGTTACTCCATTCACGGAATCCGGAGACATCGATATCGCTGCTGGCCGCGAAGT < 1:850081/249‑1 CGCGAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGGCCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCAATGGTTACTCCATTCACGGAATCCGGAGACATCGATATCGCTGCTGGCCGCGAAGTC > 2:885792/1‑249 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GAATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCAATGGTTACTCCATTCACGGAATCCGGAGACATCGATATCGCAGCTGGCCGCGAAGTCGCG > 2:335662/1‑249 AATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCAATGGTTACTCCATTCACGGAATCCGGAGACATCGATATCGCTGCTGGCCGCGAAGTCGCGG < 2:115879/249‑1 AATTCCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCCAAA‑ATGAGGGAAGAAGGTATAATTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCAATGGTTACTCCATTCACGGAATCCGGAGACATCGATATCGCTGCTGGCCGCGAAGTCGCGG < 2:457994/249‑1 || GTGAGTTCTTGGGCACCTGTCATATCCAAACCAAAGACGTGCGTTGTGGAGGGCTCTTTGGTCTCAAACGCACACTTCAACGCGCGATAAATGTGCGTTTGAGACCAAAGCGAGCTCGATTTTTGAGGCTCCTTGGTTCGAATATGCAGTTCGGCGGTGGGACCCAATAAAAACTGCCACGGCGCCCAAAGAAAATGGCTTCTCAGAATCGCCTGTGGCCGTCTCAAACTGTCATTGCCATACGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/1044670‑1044917‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCTTGCTCGTGTCAATTGTTCTTATCGGAATGTGGCTTGGGCGATTGTTATGCAAAAGTTGTTAGGTTTTTTGCGGGGTTGTTTAACCCCC‑AA‑ATGAGGGAAGAAGGTAACCTTGAACTCTATGAGCACAGGTTTAACAGCTAAGACCGGAGTAGAGCACTTCGGCACCGTTGGAGTAGCAATGGTTACTCCATTCACGGAATCCGGAGACATCGATATCGCTGCTGGCCGCGAAGTCGCGG < CP025533/2084621‑2084378 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |