| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 2272427 | 1 (0.010) | 188 (1.080) | 156/496 | 0.0 | 99.5% | coding (172/219 nt) | CYL77_10780 | hypothetical protein |
| ? | CP025533 | 2352055 = | NA (NA) | intergenic (+229/+7) | CYL77_11115/CYL77_11120 | permease/IS30 family transposase ISCg2 | |||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/2272180‑2272427‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGACACTTGGTCAC > CP025533/2352055‑2352301 CCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGG < 2:196054/249‑1 TGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGA > 2:1412462/1‑249 GTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAAT < 1:870172/249‑1 CTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTC > 2:79410/1‑249 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TACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGT < 1:659465/249‑1 ACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTG > 1:1013379/1‑249 GGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCT > 2:1082051/1‑249 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GATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATC < 1:757688/249‑1 ATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGTACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCC < 2:712576/249‑1 ATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCC > 1:143683/1‑249 CTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGA < 1:1261369/249‑1 GATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAAT < 1:548202/249‑1 GATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAAT < 2:46158/249‑1 GCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCA < 1:1009823/249‑1 TAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCG > 2:1486264/1‑249 AACTCGTACCGTACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCA < 2:819533/249‑1 CTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATT < 2:1111321/249‑1 CACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACC < 2:579920/249‑1 CGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCA > 2:1292336/1‑249 GGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCAC < 1:798188/249‑1 CCTATGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCT > 1:151423/1‑249 GACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGA > 1:786709/1‑249 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CATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGA < 2:675456/249‑1 CATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGA < 2:348590/249‑1 CCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGACACTTGGT > 1:298729/1‑249 CCTCGGGCGAATTCAATCGGCGGATGCACCAACTACGATTTTCCCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTACCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCTACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCTGACACTTGGT > 2:761469/1‑249 CTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGACACTTGGTC > 1:950150/1‑249 nCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGACACTTGGTCA < 1:339254/248‑1 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CP025533/2272180‑2272427‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGACACTTGGTCAC > CP025533/2352055‑2352301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |