| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP025533 | = 2272427 | 1 (0.010) | 188 (1.080) | 156/496 | 0.0 | 99.5% | coding (172/219 nt) | CYL77_10780 | hypothetical protein |
| ? | CP025533 | 2352055 = | NA (NA) | intergenic (+229/+7) | CYL77_11115/CYL77_11120 | permease/IS30 family transposase ISCg2 | |||||
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GCCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGAATTAGCGCAAATTTTCGATCAGAATTGGCCTCTCACGCCGGACTGAGGACGGATTTTTGCAACCCACCTCCCCTTAGGGCCCAACGGGGATTTCTGAATGTTTGCCGAGGTTCTATGGCAAGGATCCACCACAAACTGCCACCTTTCGGCAGCAATTTGTGGTGAATATTAGAACATTCTTTCCCTTTGCGTCTATTCATGGGCAACCACCGCCCAAAAGCACCCCGAAACCCGATGAAACCCTA > CP025533/2272179‑2272673 | gCCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCg < 2:679505/249‑1 (MQ=255) nncggcggtgtcaaaagcattgccacctcgcgggccgcgggtcagtttcaccccggcggccttcgcccactttcgcccggtgaattcactgaccccgaccgctgtagacgcagcaagacctgacataccttgattgatcatgtcgaggaaagccgtacggctttcctctgggattgttctacgaatgcccacttcgcacccttcgggttgctcgtggtgcattcaccccctgaacccgCCTCGAATTAg > 1:416880‑M1/239‑249 (MQ=255) nncggccgtgtcaaaagcattgccacctcgcgggccgcgggtcaggttcaccccggcggccttcgcccactttcgcccggtgaattcactgaccccgaccgctgtagacgcagcaagacctgacataccttgattgatcatgtcgaggaaagccgtacggctttcctctgggattgttctacgaatgcccacttcgcacccttcgggttgctcgtggtgcattcaccccctgaacccgCCTCGAATTAg > 2:530895‑M1/239‑249 (MQ=255) ggcggtgtcaaaagcattgccacctcgcgggccgcgggtcagtttcaccccggcggccttcgcccactttcgcccggtgaattcactgaccccgaccgctgtagacgcagcaagacctgacataccttgattgatcatgtcgaggaaagccgtacggctttcctctgggattgttctacgaatgcccacttcgcacccttcgggttgctcgtggtgcattcaccccctgaacccgCCTCGAATTAgcgc < 2:786084‑M1/14‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |