| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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|
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| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP025533 | = 1778275 | 0 (0.000) | 111 (0.950) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
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| ? | CP025533 | 2000080 = | 0 (0.000) | intergenic (‑471/+15) | CYL77_09540/CYL77_09545 | hypothetical protein/anion transporter | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GTGCGGTGCTGGAATAACTTTAGACCGAACGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTGAAAAATTGAACCGATTATGAATATTCAAAACTTCCGTGTTAACTTCTAAGCACACCGCAAGGTCCTATGGCTCAGTGGAAGAGCGTTCCGTTCACACCGGAAAGGTCGCTGGTTCGAACCCAGCTAGGACCACTTGTTTAGCCCCTGCTTGCAGGGGTTTTATTCATTTTTAGGGTTAAAAAACACGCGTTTGTGGGGTGAACGTGGGGTGAAAGAATTCATTACGAGTGCTTTTAAGCACCT > CP025533/1778027‑1778518 | gtgCGGTGCTGGAATAACTTTAGACCGAACGCTCCCTCGAACACAAATCCCCAAGTCAATGCCACAAAAGCACAGGTAAAACCCCTAGTGAAAACCCACTTTCCAAATCACACGGATGTTATTTCGCAGGACAGCAAAGAAAACCTCGAATATTTGACCAATGCTCATCGCTCCAGATTCAGAAACGTGGTGACATCCGATTTCCATCTATTAGGTACAAGAATTTCTCTTCCATATAGAAGCTGGGTg > 1:961136/1‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |