| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP025533 | = 1778275 | 0 (0.000) | 111 (0.950) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
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| ? | CP025533 | 2000080 = | 0 (0.000) | intergenic (‑471/+15) | CYL77_09540/CYL77_09545 | hypothetical protein/anion transporter | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AGAAGCCATCGCTCACCCTCTCGCCCGCGTGGGGTGAACGTGGGGTGAGTGGATTCATTTCTGGTCATTCTTGGGCGCTTCCTGCTAAAATGAAGCCATCGCGACCTCGCGTTTTATGAAGGCACCAGGGCGCTACGGCTGGTTCGAACCCAGCTAGGACCACAACTAAACCCCCTGTAAACAGGGGGTTTTCGTCGTTTCATGACTATCTATAGCTTCTTCAGCTTTTCAAGGGATGAAGGTTCCAGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAACCATGGTTGCCACAGTTGGGAGGAAAAATACGATGAGCGCTCCCCCGATGATGTCAAAGCTAATTCCAGTGCGGATCATTCGAGCAATGGATACGCAGCCCGAACCGTAGACGATGGCGTTCTGCGGTGTGGAAATCGGAAGCATGAACCCAAATGAAGCACCGAATGCAGCCGCCATAGCCGGGATAACTGGATCAATACCGGCCGCTATGGCAAGTGG > CP025533/1999833‑2000328 | gaccgaacgctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGc < 1:906074‑M2/2‑1 (MQ=255) gaacgctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGctcct > 2:159064‑M2/244‑249 (MQ=255) acgctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCg < 2:296970‑M2/8‑1 (MQ=255) gctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGAt < 1:165757‑M2/10‑1 (MQ=255) ctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGAtt < 1:645643‑M2/11‑1 (MQ=255) ctccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGAtt < 2:1245309‑M2/11‑1 (MQ=255) ccctcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTaa > 1:685864‑M2/237‑249 (MQ=255) tcgaacacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGt > 2:1145381‑M2/234‑249 (MQ=255) cacaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGcc > 1:367352‑M2/229‑249 (MQ=255) acaaatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCa < 1:878340‑M2/22‑1 (MQ=255) aatccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAAtt < 1:895923‑M2/25‑1 (MQ=255) tccccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTcc > 1:1182785‑M2/223‑249 (MQ=255) ccaagtcaatgccacaaaagcacaggtaaaacccctagtgaaaacccactttccaaatcacacggatgttatttcgcaggacagcaaagaaaacctcgaatatttgaccaatgctcatcgctccagattcagaaacgtggtgacatccgatttccatctattaggtacaagaatttctcttccatatagaagctgggtgtgtttaagtttagtggatggGCTCCTCGATTAACGTCAGCCAATTCCAAc > 1:758196‑M2/220‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |