| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | 2921785 = | 116 (0.740) | 21 (0.130) | 20/496 | 17.3 | 15.3% | coding (813/1671 nt) | CYL77_13825 | Na+/H+ antiporter subunit D |
| ? | CP025533 | = 3041097 | NA (NA) | intergenic (+7/‑308) | CYL77_14395/CYL77_14400 | IS30 family transposase ISCg2/YibE/F family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GTGGGCACGTTGAACATGGCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGCTACATGATCTTCGGCGTAGCCCTTGGATCTGCACAGGGTTTGTCTGGTGCGATCTTCTACGCAATCCACCACATTCTGGTTCAGACTTCCCTGTTCCTGGTGGTCGGTCTGGTGGAACGCCAAGCCGG > CP025533/2921537‑2922033 | cGTTGAACATGGCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTGCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTg < 2:1245168/249‑1 (MQ=255) ttGAACATGGCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGac > 2:67104/1‑249 (MQ=255) ttGAACATGGCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGac > 1:955229/1‑249 (MQ=255) aaCATGGCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACAcc < 2:263177/249‑1 (MQ=255) tGGCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGc < 2:1272198/249‑1 (MQ=255) gCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTg < 1:1281764/249‑1 (MQ=255) gCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTg > 1:93110/1‑249 (MQ=255) cTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGa < 2:871767/249‑1 (MQ=255) ttGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATgtggg > 2:602145/1‑249 (MQ=255) ttGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATgtggg < 2:379266/249‑1 (MQ=255) ggacTACGCATCAAACATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGTAGTGTTGCTCGTGCAATTCCGTATTATAGCTGCCGTGTTCTCCCTTGATACCTGGCTGCAGGAAACCTACCCCACCGCACAATCGCTGATAACCGCGTTCTTCACAGGTCTATTCACCACCGTGGGTGTATATTCCATCATTAGAGCACGCTCGATTATCTTCACCGATGAATCCCTTGACACCAGGCTGATgtgggtn > 2:221991/4‑248 (MQ=255) tGGAGGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGcca > 1:4246/1‑249 (MQ=255) aTGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGc > 1:1097051/1‑249 (MQ=255) gTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTc > 2:422065/1‑249 (MQ=255) cTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTa > 1:1509030/1‑249 (MQ=255) cTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTa > 2:214160/1‑249 (MQ=255) nggAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTAt < 1:891114/248‑1 (MQ=255) aaCTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTAtttt < 2:318407/249‑1 (MQ=255) aCTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTg < 2:1493578/249‑1 (MQ=255) aCTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTg > 1:504969/1‑249 (MQ=255) cTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTgg < 2:1389470/249‑1 (MQ=255) cTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGgcgc < 1:1454856/249‑1 (MQ=255) cgcgATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGAt < 1:262025/249‑1 (MQ=255) cgcgATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGAt > 2:833011/1‑249 (MQ=255) gCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAAc > 1:286127/1‑249 (MQ=255) gCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAAc < 2:87951/249‑1 (MQ=255) gCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCaa > 1:8201/1‑249 (MQ=255) cATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTttgt < 2:419863/249‑1 (MQ=255) cATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTttgt < 1:538206/249‑1 (MQ=255) aTTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTttgtt < 1:467423/249‑1 (MQ=255) aTTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTttgtt < 2:962767/249‑1 (MQ=255) ttCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTttgttg > 2:339535/1‑249 (MQ=255) ttCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTttgttg < 2:524867/249‑1 (MQ=255) ggTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCa > 2:6212/1‑249 (MQ=255) ggTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGATTGTTGTCa > 2:452130/1‑249 (MQ=255) tATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCAtt > 1:1019796/1‑249 (MQ=255) aTTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCAttt < 2:1317889/249‑1 (MQ=255) ttAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTa > 2:1306393/1‑249 (MQ=255) ttAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTa > 2:717150/1‑249 (MQ=255) gCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTg < 1:531156/249‑1 (MQ=255) cGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAg > 2:418891/1‑249 (MQ=255) gtgtTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGc < 2:504969/249‑1 (MQ=255) gtgtTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGc > 1:958190/1‑249 (MQ=255) tgtTCCCCCTCGATTCCTGGCTGCCTGACTCTTACCCCACCGCGCCATCGCTGTTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGTTGTGTATTCCATCATTCGAGCACTTTCGATTATTTTCTCCGATGGGTCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCAACCATGGTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCAGTTACTCTGGTCAGcc < 2:655122/249‑1 (MQ=255) tgtTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGcc > 1:1033932/1‑249 (MQ=255) gtTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCca < 2:703791/249‑1 (MQ=255) tCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCcaca < 1:1327227/249‑1 (MQ=255) cccTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAACACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCg > 1:1492372/1‑249 (MQ=255) cTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGc > 1:6942/1‑249 (MQ=255) naGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGCt < 2:318733/248‑1 (MQ=255) aGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGCTa < 1:1068350/249‑1 (MQ=255) aGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGCTa > 2:165/1‑249 (MQ=255) 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gCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGCTACATGATCtt < 1:781560/249‑1 (MQ=255) cTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGCTACATGATCTTc < 1:624432/249‑1 (MQ=255) ccTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTACGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCCCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGCTACATGATCTTCGGCGTAGccc < 1:653167/249‑1 (MQ=255) 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GTGGGCACGTTGAACATGGCTCACGTTGGCCTACGCATGGAAGATGTTCCGTCTGGAACTCGCTCCGCGATCTTCGCAGTGTTGCTCGTGGCATTCGGTATTAAAGCTGCCGTGTTCCCCCTAGATTCCTGGCTGCCGGACTCCTACCCCACCGCGCCATCGCTGGTCACCGCGGTGTTCGCAGGTCTGTTGACCAAGGTGGGTGTGTATTCCATCATTCGAGCACGCTCGATTATTTTCACCGATGGATCCCTTGACACCATGCTGATGTGGGTGGCACTCGCCACCATGCTCATTGGTATTTTGGGCGCGATGGCGCAAAACGATATCAAACGTTTGTTGTCATTTACTCTGGTCAGCCACATCGGCTACATGATCTTCGGCGTAGCCCTTGGATCTGCACAGGGTTTGTCTGGTGCGATCTTCTACGCAATCCACCACATTCTGGTTCAGACTTCCCTGTTCCTGGTGGTCGGTCTGGTGGAACGCCAAGCCGG > CP025533/2921537‑2922033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |