New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP025533 | 2110023 = | NA (NA) | 154 (0.990) | 132/496 | 0.1 | 99.4% | intergenic (+2/+13) | CYL77_10050/CYL77_10055 | ABC transporter ATP‑binding protein/ISL3 family transposase |
? | CP025533 | = 2702561 | 1 (0.010) | pseudogene (453/474 nt) | CYL77_12850 | IS630 family transposase |
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
TACCTAGCTTCGCTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATCTCCTCCGCGGTTTTGGTCCAGATAAACGGCTTAGGATCCTCGTTCCATGCTTTCACCCAGTTGCGTAAATCTTTCTCCAGGGCCTGGACACTCCGATGATCAGAACGCTGGAGTAACTCCCGGGTCACCTCAGCGAACAACCGTTCAACCTGGTTGATCCAGGACGAATACGTCGGGGTGAAGTGCATGTGAAACCGTGGATGCTTGACC > CP025533/2702314‑2702804 | tACCTAGCTTCGCTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTg > 2:1073976‑M2/1‑248 (MQ=255) 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cagggtgtaatcacctgcatcggaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATc < 1:1345018‑M2/22‑1 (MQ=255) cagggtgtaatcacctgcatcggaagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATc > 2:1014621‑M2/228‑249 (MQ=255) aaGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttag > 1:904297‑M2/1‑232 (MQ=255) 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aagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATctcc < 1:1058316‑M2/45‑1 (MQ=255) aagcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATctcc < 2:1095973‑M2/45‑1 (MQ=255) agcgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATctcct < 1:1455852‑M2/46‑1 (MQ=255) cgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATCtcctcc < 2:161015‑M2/48‑1 (MQ=255) cgccggtgatggtgagtcctagttccgcagtgcggcagatggtgtcagcgatgatgttgccggtagacttcatgggtagagccttttgttggtgtttggttagcttagatacctaaaccttaaccctgacaaaaggctcgtttattttcgggtctacaccgctagcccaggttctgtgatgtaccccaaaaccggaagggcCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATCtcctcc > 1:185002‑M2/202‑249 (MQ=255) ttGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTggctcttcctgttttagagtgcattgatcttatggaccaac < 2:12275‑M2/249‑42 (MQ=255) 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TACCTAGCTTCGCTAAAAGTGATAGCATTCGTCGGCTTTCTTGGTTTCGTCAGTTTAATAGTTGGTGTCTATTTCTGGATTACTGTTCCAGACGGGATTTTGGACGTCTTCTTTGTGCTTTTTGGCAGCGGTATCTTTCTATCCGAAGTGTTAATTAGCCTGAAGCGCTACTCGCGCTCGTCAAGTTTTTGAGACAGCTTGATTGACTTTTCTTCTTACGCTGCTGCTAGTGTCCTGCGCCGTTAATTCGTTTTAAGTATCGGGCGATAGAGGAAAGGATCTCCTCCGCGGTTTTGGTCCAGATAAACGGCTTAGGATCCTCGTTCCATGCTTTCACCCAGTTGCGTAAATCTTTCTCCAGGGCCTGGACACTCCGATGATCAGAACGCTGGAGTAACTCCCGGGTCACCTCAGCGAACAACCGTTCAACCTGGTTGATCCAGGACGAATACGTCGGGGTGAAGTGCATGTGAAACCGTGGATGCTTGACC > CP025533/2702314‑2702804 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |