| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 612724 | 2 (0.010) | 154 (1.120) | 126/496 | 0.0 | 98.7% | coding (334/1617 nt) | groL | molecular chaperone GroEL |
| ? | CP025533 | = 2632710 | NA (NA) | intergenic (‑129/‑113) | CYL77_12475/CYL77_12480 | ISL3 family transposase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TCGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/612479‑612724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTCGA < CP025533/2632710‑2632463 CGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCC > 1:649034/1‑249 CCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTT < 2:1134255/249‑1 CGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGG < 1:706950/249‑1 CGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGACACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGG < 1:148799/249‑1 CGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTT > 1:44124/1‑249 GCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTT < 1:267369/249‑1 GCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTT < 2:389692/249‑1 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GTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCAT > 2:254889/1‑249 GAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAACGGCTCTACCCATGA > 1:235333/1‑249 AGTCCGTGGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAG < 2:463262/249‑1 CCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCT > 1:851457/1‑249 GTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGCCGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCCAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGCAACTAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGGTTAGGTATCTCAGCTCACCAGACCCCAACCAAAGGCTCTACCCATGCAGTCTAC > 2:163901/1‑249 AAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAACCACAACCAAAAGGATCTAGCCATGAAGTCTACCGGAAAAAT > 2:361912/1‑249 AAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACAT < 1:500188/249‑1 AAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACAT < 2:916299/249‑1 ACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGAC < 2:432035/249‑1 GCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCAT > 1:804976/1‑249 CTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATC > 2:1013456/1‑249 CGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGG‑TTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCAC < 1:709933/249‑1 CACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGG < 2:478383/249‑1 ACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACT < 1:1221106/249‑1 CTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGCACTn > 2:1066667/1‑248 nGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAG < 2:824406/248‑1 ACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACT > 2:677153/1‑249 TCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCA > 2:4752/1‑249 TTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACAATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATC > 2:836226/1‑249 GCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCAC < 1:111815/249‑1 CACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCT > 2:250724/1‑249 CATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCG < 2:328975/249‑1 ATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGA < 1:90234/249‑1 TGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGATACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCGACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATG > 1:593067/1‑249 GCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGC > 2:826141/1‑249 CTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCA < 2:793591/249‑1 GAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGG > 1:236310/1‑249 AGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTG < 2:1331375/249‑1 CCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATT > 2:1099623/1‑249 CCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATT > 2:714673/1‑249 CTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTA < 2:1229860/249‑1 GCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACC > 2:1315687/1‑249 ACGTTGCTGCTGGCGCAAACGGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTGGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGGGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGGCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCACTTCCGATGCAGGAGAGTACGACCTG > 2:1148432/1‑249 CGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGA > 1:631933/1‑249 TTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATC < 2:136428/249‑1 TGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCG < 1:134347/249‑1 CTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAn > 1:431832/1‑248 nggTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAG < 2:1022566/246‑1 GCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCCCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGC > 1:950032/1‑249 GGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGA < 2:723082/249‑1 GCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGAC > 2:520371/1‑249 AAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCAC > 1:675474/1‑249 AAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCAC < 1:67547/249‑1 ACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTC > 1:370346/1‑249 ACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGACCGAAGCAGACGCACTC > 1:902431/1‑249 CCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTCG > 1:167682/1‑249 CGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTCGA < 2:851457/249‑1 CGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTCGA > 1:1012294/1‑249 TCGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/612479‑612724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACTCGA < CP025533/2632710‑2632463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |