| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 612724 | 2 (0.010) | 154 (1.120) | 126/496 | 0.0 | 98.7% | coding (334/1617 nt) | groL | molecular chaperone GroEL |
| ? | CP025533 | = 2632710 | NA (NA) | intergenic (‑129/‑113) | CYL77_12475/CYL77_12480 | ISL3 family transposase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
TCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTAAGTGGCTCAAGGAAGACAAGCATCCAACAAGAACGAACCCTGCATCCCATTCCTAAAATAGTGGATGGTGTCTATATTTTTAGGTCGGGATCAGAACAGCCGCGCTTATGAAATCAGATGAGGCATGGATCGCTGGGTATAAGGCGGCGGCGCCGTTTCTATTGATTGCAGCAATCGGGATTGTTGCGTCTGGGGTGGCCTCAATTTTTGTGCCGTTTGATGCGGTCGCAACTGTATCAATGA > CP025533/2632463‑2632958 | tCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCACGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCct < 1:641248/249‑1 (MQ=11) cGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCctc < 2:1228793/249‑1 (MQ=11) tGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTaa < 2:239282/249‑1 (MQ=32) cGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTAGGt > 2:1351820/1‑249 (MQ=17) cGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTAAGt > 1:25662/1‑249 (MQ=33) ntCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTAAGTGGCTCaa < 2:129010/248‑1 (MQ=37) cGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTAAGTGGCTCAAgg > 2:1098508/1‑249 (MQ=38) 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TCGAGTGCGTCTGCTTCGATCAGGGTGTAATCACCTGCATCGGAAGCGCCGGTGATGGTGAGTCCTAGTTCCGCAGTGCGGCAGATGGTGTCAGCGATGATGTTGCCGGTAGACTTCATGGGTAGAGCCTTTTGTTGGTGTTTGGTTAGCTTAGATACCTAAACCTTAACCCTGACAAAAGGCTCGTTTATTTTCGGGTCTACACCGCTAGCCCAGGTTCTGTGATGTACCCCAAAACCGGAAGGGCCTCTTAAGTGGCTCAAGGAAGACAAGCATCCAACAAGAACGAACCCTGCATCCCATTCCTAAAATAGTGGATGGTGTCTATATTTTTAGGTCGGGATCAGAACAGCCGCGCTTATGAAATCAGATGAGGCATGGATCGCTGGGTATAAGGCGGCGGCGCCGTTTCTATTGATTGCAGCAATCGGGATTGTTGCGTCTGGGGTGGCCTCAATTTTTGTGCCGTTTGATGCGGTCGCAACTGTATCAATGA > CP025533/2632463‑2632958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |