| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | CP025533 | 2,042,148 | 725 bp→TGTTTAAGTTTAGTGGATGG | coding (19‑743/780 nt) | CYL77_09745 → | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP025533 | 2042148 | 2042872 | 725 | 120 [0] | [0] 122 | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP025533 | = 2042147 | 0 (0.000) | 111 (0.880) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
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| ? | CP025533 | 2042873 = | 0 (0.000) | coding (744/780 nt) | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GGGTAATCGGGCAAATAAGTTTTTGCTGATCTAGAAAGTGAGTTTACCTGTGGGTTTTCGAAAATTCTGGGCCGGACAATAGAAAAACGCTGCCCGGTTTTTTTGATTGACTCCCGATTTCACCCCTCCGCCGGCAACCAAATGAGGCTTTTGGGCGTTGGACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/2041902‑2042147‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACG > CP025533/2042873‑2043118 |||||||||||||||||||| GGGTAATCGGGCAAATAAGTTTTTGCTGATCTAGAAAGTGAGTTTACCTGTGGGTTTTCGAAAATTCTGGGCCGGACAATAGAAAAACGCTGCCCGGTTTTTTTGATTGACTCCCGATTTCACCCCTCCGCCGGCAACCAAATGAGGCTTTTGGGCGTTGGACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGT > 2:864607/1‑249 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GCGTTGGACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGT < 1:868236/249‑1 TGGACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCC > 2:79342/1‑249 ACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGT > 1:1207696/1‑249 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GGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGTTTTTGGCCCCGGTGTGGCTACCAC > 2:654283/1‑249 GGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCAC < 2:1074192/249‑1 ACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCT < 1:123823/249‑1 ATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTT < 1:79342/249‑1 TTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTT < 2:264940/249‑1 AAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGC < 1:139584/249‑1 TTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGC < 2:1007411/249‑1 TGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCA > 1:878263/1‑249 nTTTTGCATTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGATTAAGCTTAGGGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATGGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGA < 2:1257031/248‑1 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TTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTT > 2:684840/1‑249 TTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTG > 2:249697/1‑249 GGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGATGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTATGCAGT > 2:66962/1‑249 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ACGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCC < 2:58092/249‑1 CGCAGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCn > 2:338026/1‑248 AGAGGAGCGCTGTTTAAGTTTAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAA > 1:1015911/1‑249 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TAGTGGATGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCT > 1:350172/1‑249 AGTGGATGGGAGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTG < 2:820833/249‑1 TGGGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACG < 2:1187204/249‑1 |||||||||||||||||||| GGGTAATCGGGCAAATAAGTTTTTGCTGATCTAGAAAGTGAGTTTACCTGTGGGTTTTCGAAAATTCTGGGCCGGACAATAGAAAAACGCTGCCCGGTTTTTTTGATTGACTCCCGATTTCACCCCTCCGCCGGCAACCAAATGAGGCTTTTGGGCGTTGGACAGTGAGACAATGGGTAAGAAATTCGGACATATTTAGTAAATTGGCTTTTTGCTTTAAGGAGTGACATGTACGCAGAGGAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/2041902‑2042147‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACG > CP025533/2042873‑2043118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |