| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | CP025533 | 2,042,148 | 725 bp→TGTTTAAGTTTAGTGGATGG | coding (19‑743/780 nt) | CYL77_09745 → | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | CP025533 | 2042148 | 2042872 | 725 | 120 [0] | [0] 122 | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 2042147 | 0 (0.000) | 111 (0.880) +TGTTTAAGTTTAGTGGATGG |
94/456 | 0.3 | 100% | coding (18/780 nt) | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator |
| ? | CP025533 | 2042873 = | 0 (0.000) | coding (744/780 nt) | CYL77_09745 | DeoR/GlpR transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TCGCGCTGATGCGTGCGGATGTAGTGTTCATCGGCACCAACGCGTTGACGTTGGATCACGGATTGTCTACGGCCGATTCCCAAGAGGCTGCCATGAAATCTGCGATGATCACCAACGCCCACAAGGTGGTGGTGTTGTGTGACTCCACCAAGATGGGCACCGACTACCTCGTGAGCTTTGGCGCAATCAGCGATATCGATGTGGTGGTCACCGATGCGGGTGCACCAGCAAGTTTCGTTGAGCAGTTGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACG > CP025533/2042626‑2043118 | tttttgctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGc < 1:1188276‑M2/2‑1 (MQ=255) ttttgctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggTCg > 1:58092‑M2/247‑249 (MQ=255) ttttgctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCg > 2:374534‑M2/247‑249 (MQ=255) tgctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCgaga > 2:868236‑M2/244‑249 (MQ=255) gctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCgag > 1:283095‑M2/243‑247 (MQ=255) gctgatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCgag < 2:283095‑M2/5‑1 (MQ=255) gatctagaaagtgagtttacctgtgggttttcgaaaattctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAAcgc > 1:690988‑M2/240‑249 (MQ=255) 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ttctgggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGt > 1:797203‑M2/203‑249 (MQ=255) ggccggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTg < 1:1315525‑M2/52‑1 (MQ=255) ggacaatagaaaaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAg > 2:123823‑M2/194‑249 (MQ=255) 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aaacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGt < 2:1089347‑M2/67‑1 (MQ=255) aacgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgccgaggagcgctgtttaagtttggtggatggGCGAGAACGCGATGTAGATGTTGTGATTGCCGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGtt > 2:1356746‑M2/182‑249 (MQ=255) acgctgcccggtttttttgattgactcccgatttcacccctccgccggcaaccaaatgaggcttttgggcgttggacagtgagacaatgggtaagaaattcggacatatttagtaaattggctttttgctttaaggagtgacatgtacgcagaggagcgctgtttaagtttagtggatggGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTg > 2:902339‑M2/181‑249 (MQ=255) 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TCGCGCTGATGCGTGCGGATGTAGTGTTCATCGGCACCAACGCGTTGACGTTGGATCACGGATTGTCTACGGCCGATTCCCAAGAGGCTGCCATGAAATCTGCGATGATCACCAACGCCCACAAGGTGGTGGTGTTGTGTGACTCCACCAAGATGGGCACCGACTACCTCGTGAGCTTTGGCGCAATCAGCGATATCGATGTGGTGGTCACCGATGCGGGTGCACCAGCAAGTTTCGTTGAGCAGTTGCGAGAACGCGATGTAGAAGTTGTGATTGCAGAATGATTCTTACAGTCACTGCAAGTCCGTATCTGTTGAGCACCAATGAGCTTGACGGCACCATCGAAATTGGCGAAGCAAACAAAATCCGGCAGGTTTCCACTGTTGCCGGTGGTTTTGGCACCGGTGTGGCTGCCACCTTGTTTTATGGCGGCAATGAAACTTTTGCAGTTTTTCCCGCTCCAGAAATCTCTCATTACATGCGCCTGGTGACG > CP025533/2042626‑2043118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |