| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | 272376 = | 127 (0.950) | 117 (0.890) +CT |
104/492 | 0.2 | 49.6% | intergenic (+8/‑16) | CYL77_01365/CYL77_01370 | aspartate kinase/aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
| ? | CP025533 | 2085498 = | 113 (0.850) | intergenic (‑47/+5) | CYL77_09945/CYL77_09950 | thymidylate synthase (FAD)/4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate reductase | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP025533/272622‑272376‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTCGGT > CP025533/2085498‑2085745 || GGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCT < 2:783090/249‑1GGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCT < 1:849319/249‑1GGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCT < 1:8880/249‑1 GTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTA < 1:47970/249‑1 TGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCTTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAG < 1:1209458/249‑1 TGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAG < 2:763755/249‑1 GCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGC < 2:451825/249‑1 CTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCT > 1:618413/1‑249 CCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTT < 1:194850/249‑1 GAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGC < 2:37124/249‑1 AGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCC > 2:174510/1‑249 AACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTn > 2:705099/1‑248 ACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTA < 1:15019/249‑1 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GTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCA > 2:1076395/1‑249 GAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACT > 2:692939/1‑249 acGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTGACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTA < 2:160557/247‑1 GGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAG < 2:272114/249‑1 CTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCT > 1:1020938/1‑249 CCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGG > 2:1046263/1‑249 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AATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTG > 1:1282929/1‑249 GTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGC > 1:1050867/1‑249 TCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCA > 1:352175/1‑249 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TCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACAC < 2:268318/249‑1 TCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACAC < 1:1199376/249‑1 CCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCAC > 1:39218/1‑249 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nTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGAT < 1:436929/248‑1 CGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCAT < 1:88279/249‑1 CCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGG < 2:1037623/249‑1 CTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGn > 1:32841/1‑248 nGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAG < 1:692939/248‑1 GAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCGACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCT < 2:662805/249‑1 AACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTG > 2:778003/1‑249 CGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCT > 2:1134571/1‑249 TGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTG < 1:916704/249‑1 TGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTG > 2:383961/1‑249 GGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGCTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATG > 1:1231760/1‑249 GCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCA < 2:1124077/249‑1 AAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAG > 2:353465/1‑249 AAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGG > 2:761052/1‑249 AACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTG < 1:767790/249‑1 ACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCT < 1:751191/249‑1 AGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGG > 2:884268/1‑249 GTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTG > 2:312177/1‑249 GGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGA < 1:247304/249‑1 GGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGAT < 1:50073/249‑1 GAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATA < 2:857413/249‑1 CGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCT < 2:333407/249‑1 GCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTC < 2:1145615/249‑1 CAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCA < 2:447801/249‑1 AAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAA < 2:366859/249‑1 AAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAAC < 1:735558/249‑1 GGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCAT < 1:1187508/249‑1 GGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATG < 1:664508/249‑1 GCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCG < 2:527471/249‑1 GCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGA > 2:847892/1‑249 GCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGA > 1:1233878/1‑249 AACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATG > 1:937962/1‑249 TGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGA > 2:125122/1‑249 GGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGAC < 2:1165688/249‑1 GCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACT > 1:287548/1‑249 CGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGGCATGCGGACTGC > 2:916446/1‑249 CTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGA > 2:557445/1‑249 TGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAA > 1:208377/1‑249 GCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACC > 1:359038/1‑249 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CAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTAC < 1:21517/249‑1 CAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTAC < 1:961092/249‑1 nGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGAGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACTTGGTGCAAATGAGTTGCGCTCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTT < 2:542024/248‑1 TGGTCATTGTAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACG < 1:757332/249‑1 TAAAACTACTCCTTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTC < 2:618413/249‑1 TTCTAGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTC > 2:984948/1‑249 || GGTGCCTCCAGCGGAGAACAACGCAACGTCGATGTCCTTGAGGGACTCCTCGGTTGCCTGAGTAATGTCTTCTACCTCGATTTCCGTGCCACGGAATTCAATCTTACGGCCTGCGGAACGTGGGGAAGCAAAGAAACGAACAGTGTCAGCTGGGAAATTGCGCTCTTCCAAAAGGGTGCGCATAACCTGGCCGACCTGGCCGGTTGCACCAACAACTGCGATGGTGGTCATTGTAAAACTACTCCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP025533/272622‑272376‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCTTTACAGGCCTAGGTAATGCTCAAGTCCTACGACTAGGCCTGGGTGCTGTGCAATGTTGCGCACACCCACCAAGACACCTGGTGCAAATGAGTTGCGATCATAGGAGTCCTGCTTGATGGTCAAGGTCTGACCCTGGGTGCCAAAGATAACTTGCTCGTGAGCAACCATGCCGGACATGCGGACTGCATGAACCGGGATTCCATCTACGCTTGCGCCACGGGAACCCTCAAGTGCCTGCTCGGT > CP025533/2085498‑2085745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |