| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 2272427 | 1 (0.010) | 121 (0.910) | 108/496 | 0.1 | 99.2% | coding (172/219 nt) | CYL77_10780 | hypothetical protein |
| ? | CP025533 | 2352055 = | NA (NA) | intergenic (+229/+7) | CYL77_11115/CYL77_11120 | permease/IS30 family transposase ISCg2 | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/2272180‑2272427‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGACACTTGGTCACC > CP025533/2352055‑2352302 CCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGG < 2:412659/249‑1 CCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGG > 1:837468/1‑249 CCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGAGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGG > 2:1043792/1‑249 TCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATT < 1:991784/249‑1 GCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAAT < 1:621771/249‑1 ATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCG < 2:1005234/249‑1 AGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAACCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTG < 2:540853/249‑1 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AGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTAC > 1:1295773/1‑249 GACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACG > 2:596153/1‑249 CTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTT > 2:237475/1‑249 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GCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTACATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCGCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGAGTGCGCTAATCAAGAATTCGTCACGGACCTGTAGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGAATATACCCCTCGGGCGCATCCAATCTGTTGACGCACCAACTACGATTTTTTCATATACtttagt > 2:1212409/1‑243 GATTTAAAGGGTGGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATGTTGTTACCAGGATGACAGGTTTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCGAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATTCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATGCCTGCGTCG < 2:141792/249‑1 GATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCG > 2:310564/1‑249 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TCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAG > 1:20079/1‑249 CTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGC > 1:738188/1‑249 TTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAAT > 1:267341/1‑249 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GTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAA > 1:768199/1‑249 TCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCT < 1:1023763/249‑1 CCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTG > 1:1067692/1‑249 CTGTGGATGCGCTAATCAAGGACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGA < 1:514832/249‑1 CTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGA < 2:635217/249‑1 GCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCA < 1:758496/249‑1 AATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGT < 2:638562/249‑1 CAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATT < 1:1011049/249‑1 AAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTC > 1:1002976/1‑249 ACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCAT < 1:19489/249‑1 ACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCAT < 2:660685/249‑1 ACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCAT < 1:237475/249‑1 nCGTCACGGATCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTC < 1:667093/248‑1 CGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCG < 1:629505/249‑1 CGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCA > 1:1181061/1‑249 GACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACG > 1:238569/1‑249 GTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCC > 2:887387/1‑249 TGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCA > 1:461195/1‑249 CAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGC < 2:296684/249‑1 AGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCG < 2:62197/249‑1 AGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCG > 1:1201852/1‑249 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ACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGA > 1:485831/1‑249 CGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAA < 1:53660/249‑1 CGAATTTTTGCATATCCCCCTCGGGCGAATTAAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTTCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTTCGCTGCCAGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGGAAATTTAGTGCCCTTCGGGAAAATATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCTACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAA < 1:971527/249‑1 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CP025533/2272180‑2272427‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCGAATTCAATCGGTGGATGCACCAACTACGATTTTTTCATATACCTGCGTCGCGCTTTTAAAACCATGCATTTTCCGCGGCCGGTAATTCAGCAGATCCTGTGCCCGCTGAACTTCTTCGTCACTTACTTTAGCAAAATTAGTGCCCTTCGGGAAAAAATCCCTGACCAATCCATTCGTATTCTCATTCGACCCACGCTGCCACGGCGAATGAGGATCACAGAAAAACACCGGACACTTGGTCACC > CP025533/2352055‑2352302 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |