New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | CP025533 | = 2272427 | 1 (0.010) | 121 (0.910) | 108/496 | 0.1 | 99.2% | coding (172/219 nt) | CYL77_10780 | hypothetical protein |
? | CP025533 | 2352055 = | NA (NA) | intergenic (+229/+7) | CYL77_11115/CYL77_11120 | permease/IS30 family transposase ISCg2 |
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
CCCTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGAATTAGCGCAAATTTTCGATCAGAATTGGCCTCTCACGCCGGACTGAGGACGGATTTTTGCAACCCACCTCCCCTTAGGGCCCAACGGGGATTTCTGAATGTTTGCCGAGGTTCTATGGCAAGGATCCACCACAAACTGCCACCTTTCGGCAGCAATTTGTGGTGAATATTAGAACATTCTTTCCCTTTGCGTCTATTCATGGGCAACCACCGCCCAAAAGCACCCCGAAACCCGATGAAACCCTATT > CP025533/2272180‑2272675 | cccTTGGTCTTGCATTAGGTTGGGCAGTGAAGACCCCTTTGGCTCGAGAAGGCGATTTAAAGGGTCGGATTTTCACATGGACCTTTGGTGTGGATGGGGTGCATTCAGGCGCTTAAAAGTGATTCTGAAAGGGCTCTATTTTGTTACCAGGATGACAGGTGTGATTCCTGTGGATGCGCTAATCAAGAACTCGTCACGGACCTGTGGCCAGACCATTAAATCGAACGAATTTTTGCATATCCCCCTCGg < 2:412659‑M1/249‑2 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |