New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AM260480 | = 2192077 | 16 (0.730) | 4 (0.180) | 4/204 | 1.7 | 20.0% | coding (368/822 nt) | h16_B1943 | putative non‑heme chloroperoxidase |
? | AM260480 | 2192114 = | 16 (0.730) | coding (331/822 nt) | h16_B1943 | putative non‑heme chloroperoxidase |
ACGGCGTCGCCAGGTCCTGGTAGAACTGCGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCCA > AM260480/2191958‑2192203 | aCGGCGTCGCCAGGTCCTGGTAGAACTGCGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATc < 1:638407/134‑1 (MQ=255) aCGGCGTCGCCAGGTCCTGGTAGAACTGCGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATc < 2:246765/134‑1 (MQ=255) cGGCGTCGCCAGGTCCTGGTAGAACTGCGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGAt > 2:200748/1‑132 (MQ=255) tCCTGGTAGAACTGCGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGc < 1:200748/134‑1 (MQ=255) cGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGc > 1:191697/1‑134 (MQ=255) cGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCAc < 2:948180/92‑1 (MQ=255) cGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCAc > 1:948180/1‑92 (MQ=255) ggTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGcggtgccatggcggccgatgtagtgcgccacctcgccgccaccggtg > 1:681688‑M1/1‑87 (MQ=255) ggTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATgg < 2:191697/134‑1 (MQ=255) ggCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGcggtgccatggcggccgatgtagtgcgccacctcgccgccaccggtggaatgcc < 2:681688‑M1/134‑55 (MQ=255) cTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGcggtgc < 1:687217‑M1/77‑7 (MQ=255) cTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGcggtgc > 2:687217‑M1/1‑71 (MQ=255) cTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTgcg > 1:775062/1‑134 (MQ=255) atcgGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCg > 1:815027/1‑126 (MQ=255) atcgGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCg < 2:815027/126‑1 (MQ=255) atcgGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATg < 1:92716/134‑1 (MQ=255) atcgGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATg > 2:770142/1‑134 (MQ=255) ttGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCAt < 2:1029492/121‑1 (MQ=255) ttGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCAt > 1:1029492/1‑121 (MQ=255) aTCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCca < 1:770142/133‑1 (MQ=255) | ACGGCGTCGCCAGGTCCTGGTAGAACTGCGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCCA > AM260480/2191958‑2192203 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |