New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AM260480 | = 2192077 | 16 (0.730) | 4 (0.180) | 4/204 | 1.7 | 20.0% | coding (368/822 nt) | h16_B1943 | putative non‑heme chloroperoxidase |
? | AM260480 | 2192114 = | 16 (0.730) | coding (331/822 nt) | h16_B1943 | putative non‑heme chloroperoxidase |
CGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCCAGCAGCGCGGCCAGGTCGTCGGCGTAGGTGTCCATGTCGTTGCC > AM260480/2191986‑2192246 | cGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGc > 1:191697/1‑134 (MQ=255) ggTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATgg < 2:191697/134‑1 (MQ=255) cTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTgcg > 1:775062/1‑134 (MQ=255) ggttgtcggccacgcccttgcggatgccgtcgaacacatcgatcggcagcccgccggggttggccgcggtcttgagcatgatcggcgCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTg > 1:681688‑M2/88‑134 (MQ=255) atcgGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCg < 2:815027/126‑1 (MQ=255) atcgGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCg > 1:815027/1‑126 (MQ=255) atcgGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATg < 1:92716/134‑1 (MQ=255) atcgGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATg > 2:770142/1‑134 (MQ=255) ggccacgcccttgcggatgccgtcgaacacatcgatcggcagcccgccggggttggccgcggtcttgagcatgatcggcgCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGcc < 2:681688‑M2/54‑1 (MQ=255) cttgcggatgccgtcgaacacatcgatcggcagcccgccggggttggccgcggtcttgagcatgatcggcgCGGTGc < 1:687217‑M2/6‑1 (MQ=255) cttgcggatgccgtcgaacacatcgatcggcagcccgccggggttggccgcggtcttgagcatgatcggcgCGGTGc > 2:687217‑M2/72‑77 (MQ=255) ttGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCAt < 2:1029492/121‑1 (MQ=255) ttGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCAt > 1:1029492/1‑121 (MQ=255) aTCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCca < 1:770142/133‑1 (MQ=255) cGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCCAGCAGCGCGGCCAGgtcg > 1:957006/1‑134 (MQ=255) ggCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCCAGCAGCGCGGCCacgggc > 1:696347/1‑113 (MQ=255) ggCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCCAGCAGCGCGGCCacgggc < 2:696347/118‑6 (MQ=255) acacGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATc < 1:377732/77‑1 (MQ=255) acacGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATc > 2:377732/1‑77 (MQ=255) ccGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCCAGCAGCGCGGCCAGGTCGTCGGCGTAGGTGTCCATGTCGTTGcc > 1:858947/1‑134 (MQ=255) | CGAGCGGTTGTCGGCCACGCCCTTGCGGATGCCGTCGAACACATCGATCGGCAGCCCGCCGGGGTTGGCCGCGGTCTTGAGCATGATCGGCGGCACCGCGCCGATCAGCACCGCCTTGGCGACACGGCCGGTGCCATGGCGGCCGATGTAGTGCGCCACCTCGCCGCCACCGGTGGAATGCCCCACCAGCGTGGCATCGCGCAGGTCCAGCGCGTCCAGCAGCGCGGCCAGGTCGTCGGCGTAGGTGTCCATGTCGTTGCC > AM260480/2191986‑2192246 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |