New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AM260479 | = 3787147 | 30 (1.190) | 8 (0.360) | 6/180 | 1.3 | 22.7% | coding (821/1674 nt) | h16_A3514 | Long‑chain‑fatty‑acid‑CoA ligase |
? | AM260479 | = 3787178 | 28 (1.250) | coding (852/1674 nt) | h16_A3514 | Long‑chain‑fatty‑acid‑CoA ligase |
TTGGCGACAGTGACGTACTGTGCATCCCGGTGCCGCTCTATCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTATCGCCCAGCTGGACCATCCGGAGTTCAGCCGCTTCGACTTCTCGGCCCTGCGCACCGGCATCATGG > AM260479/3787048‑3787305 | ttGGCGACAGTGACGTACTGTGCATCCCGGTGCCGCTCTATCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGac < 2:526515‑M2/133‑3 (MQ=255) tCCCGGTGCCGCTCTATCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcaggcgc < 2:783795‑M2/120‑14 (MQ=255) tCCCGGTGCCGCTCTATCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcaggcgc > 1:783795‑M2/1‑107 (MQ=255) tCCCGGTGCCGCTCTATCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc > 1:317091/1‑134 (MQ=255) gTGCCGCTCTATCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCAc > 2:641694/1‑134 (MQ=255) tATCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTg < 1:526515/132‑1 (MQ=255) aTCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcaggcgccgaccga < 2:1001134‑M2/112‑21 (MQ=255) aTCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcaggcgccgaccga > 1:1001134‑M2/1‑92 (MQ=255) aTCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcaggcgc < 2:587512‑M2/105‑14 (MQ=255) aTCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcaggcgc > 1:587512‑M2/1‑92 (MQ=255) aTCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcagg > 1:952179‑M2/1‑92 (MQ=255) aTCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcagg < 2:952179‑M2/102‑11 (MQ=255) aTCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCAt > 2:117978/1‑134 (MQ=255) tGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGttt < 1:160120/134‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGttt < 1:641694/134‑1 (MQ=255) tGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGttt < 2:243220/134‑1 (MQ=255) cTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTAt < 2:317091/134‑1 (MQ=255) gCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc > 2:23966/1‑87 (MQ=255) gCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc < 1:1012599/87‑1 (MQ=255) gCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc < 1:23966/87‑1 (MQ=255) gCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc > 2:1012599/1‑87 (MQ=255) gCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTATCGCCCAGCTGGa > 1:447397/1‑134 (MQ=255) gCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc < 2:488306/83‑1 (MQ=255) gCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc > 1:488306/1‑83 (MQ=255) gCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTg > 2:128991/1‑85 (MQ=255) gCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTg < 1:128991/85‑1 (MQ=255) tcggtcggCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTATCGCCCAGCTGGACCATCCg > 1:1062773/1‑132 (MQ=255) tcggCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTATCGCCCAGCTGGACCATCCGGAGTTc < 1:343085/134‑1 (MQ=255) gcCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTATCGCCCAGCTGGACCATCCGGAGTTCAGCCg < 2:447397/134‑1 (MQ=255) ccTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcaggcgccgaccgagacgcaggccagcaccgacagcaccatgccgaagcagtgatagagcggcaccgggatgcacagtacgtcactg < 1:768113‑M2/134‑94 (MQ=255) tGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCAc > 1:595744/1‑71 (MQ=255) tGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCAc < 2:595744/71‑1 (MQ=255) aTGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGaccatgcaggcgccgaccgagacgcaggccagcaccgacagcaccatgccgaagcagtgatagagcggcaccgggatgcacagtacgtcactgtcgcc > 2:768113‑M2/1‑36 (MQ=255) cGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTATCGCCCAGCTGGACCATCCGGAGTTCAGCCGCTTCGACTTCTCGGcc > 1:589474/1‑134 (MQ=255) gCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc > 1:50067/1‑45 (MQ=255) gCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc < 2:332958/45‑1 (MQ=255) gCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc > 1:332958/1‑45 (MQ=255) gCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGc < 2:50067/45‑1 (MQ=255) gCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTATCGCCCAGCTGGACCATCCGGAGTTCAGCCGCTTCGACTTCTCGGCCCTGCGCACCGGCATCATgg < 1:970671/134‑1 (MQ=255) | TTGGCGACAGTGACGTACTGTGCATCCCGGTGCCGCTCTATCACTGCTTCGGCATGGTGCTGTCGGTGCTGGCCTGCGTCTCGGTCGGCGCCTGCATGGTGTTCCCGGGCGAGGCCTTCGATCCGCTCGCGACCATGCAGGCGGCCAGCGAGGAACGCTGCACCGCCCTGCATGGCGTGCCGACCATGTTTATCGCCCAGCTGGACCATCCGGAGTTCAGCCGCTTCGACTTCTCGGCCCTGCGCACCGGCATCATGG > AM260479/3787048‑3787305 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |