Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	AM260479	1206106	1206172	67	2 [0]	[0] 2	h16_A1108	conserved hypothetical protein

CATGCGGGTCCGGTACTCGGACAGGCTGACGCGGCCGCGGTCGGGCAGGGTGACGGTCTTGGTGGGTGGCGTG  >  AM260479/1206033‑1206105                                                                         | cATGCGGGTCCGGTACTCGGACAGGCTGACGCGGCCGCGGTCGGGCAGGGTGACGGTCTTGGTGGGTGGCGTg  <  1:764363/73‑1 (MQ=255) cATGCGGGTCCGGTACTCGGACAGGCTGACGCGGCCGCGGTCGGGCAGGGTGACGGTCTTGGTGGGTGGCGTg  >  2:764363/1‑73 (MQ=255)                                                                         | CATGCGGGTCCGGTACTCGGACAGGCTGACGCGGCCGCGGTCGGGCAGGGTGACGGTCTTGGTGGGTGGCGTG  >  AM260479/1206033‑1206105

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑