| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AssemblyC74_contig_1 | 443402 = | 1145 (2.870) | 239 (0.670) | 65/254 | 1.3 | 29.4% | intergenic (+531/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/– | Conserved hypothetical protein ArsC related/– |
| ? | AssemblyC74_contig_6 | = 168934 | 0 (0.000) | intergenic (+543/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Phosphate regulon sensor protein PhoR (SphS) (EC 2.7.13.3)/– | |||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
‑‑‑ACGATTGTTAAGCTCAATTTGTTTGCTAGCATATTGCTTGCTTGTTAAAAAATGTTTGTTGTCTTGAATTGAATCAAGACGCCCTACACATTTGGTTTGTCTTACTTTGTTCAGTTTTCAAAGGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_1/443529‑443402‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCTTTTTGTTTCAACAACTCTTTAATCTTATCAGATTCAGAAGAGAATGTCAACAACTTCTTTGTTTATTTTTTCTAAACGTCTTTGCCACTCATTAGCAGCGACTTGATTATCATATCATCTTTATTGTTAT < AssemblyC74_contig_6/168934‑168801 cttgCGATTGTTAAGCTCAATTTGTTTGCTAGCATATTGCTTGCTTGTT‑AAAAATGTTTGTTGTCTTGAATTGAATCAAGACGCCCTACACATTTGGTTTGTCTTACTTTGTTCAGTTTTCAAAGGTCTAATCTT < 2:1697277/131‑1 GTTAAGCTCAATTTGTTTGCTAGCATATTGCTTGCTTGTT‑AAAAATGTTTGTTGTCTTGAATTGAATCAAGACGCCCTACACATTTGGTTTGTCTTACTTTGTTCAGTTTTCAAAGGTCTAATCTTTTTGTTTCA < 1:212422/135‑1 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‑‑‑ACGATTGTTAAGCTCAATTTGTTTGCTAGCATATTGCTTGCTTGTTAAAAAATGTTTGTTGTCTTGAATTGAATCAAGACGCCCTACACATTTGGTTTGTCTTACTTTGTTCAGTTTTCAAAGGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_1/443529‑443402‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCTTTTTGTTTCAACAACTCTTTAATCTTATCAGATTCAGAAGAGAATGTCAACAACTTCTTTGTTTATTTTTTCTAAACGTCTTTGCCACTCATTAGCAGCGACTTGATTATCATATCATCTTTATTGTTAT < AssemblyC74_contig_6/168934‑168801 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |