| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_30 | = 330 | 229 (0.990) | 238 (0.970) | 73/254 | 0.2 | 67.5% | intergenic (+78/+111) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein/hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_36 | = 1754 | 0 (0.000) | intergenic (+133/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CACCAATATGCGTTTGCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTCATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_30/198‑330‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACATTCACTAACTTT < AssemblyC74_contig_36/1754‑1623 CACCAATATGCGCTTGCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTGTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAG > 2:2236303/1‑135 ATATGCGCTTGCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTAT < 2:2664142/135‑1 TGCGCTTGCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCA > 1:2127980/1‑135 TGCGCTTGCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCA > 1:1094816/1‑135 TGCGCTTGCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCA > 2:2521950/1‑135 gcTTGCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAAT > 2:1203472/3‑135 GCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACT < 1:209792/135‑1 GCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACT < 2:1821810/135‑1 CGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTG > 2:2141679/1‑135 CGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTG > 1:688610/1‑135 GATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGA > 1:139161/1‑135 ATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAA > 1:1314439/1‑135 ATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACAACAAAGCTAGTGACTATTACTAAATTTGATGTATATAGATGAACTAATCAGTCCTATTTGACAAAGAGACAAGATTATTCAAATTACTctaa > 2:2357008/1‑131 ATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATC > 1:2554910/1‑135 GTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAA > 2:1459013/1‑135 GTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAA > 1:1743314/1‑135 GTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAA > 1:1960912/1‑135 CACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAA > 1:863135/1‑135 CACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAA > 2:751168/1‑135 CACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAA > 1:2934326/1‑135 ACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAA > 2:2458899/1‑135 ACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAA > 1:1021423/1‑135 ACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAA > 1:1193459/1‑135 TAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAA < 1:2081094/135‑1 cAAAAAACATCACAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAA < 2:3383218/134‑1 AAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAA < 1:2058846/135‑1 AAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTT > 1:699085/1‑135 AAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTT > 2:1145053/1‑135 AAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTT > 1:513631/1‑135 AAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTT > 2:2824548/1‑135 AAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTG < 2:463679/135‑1 AAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTG < 2:582733/135‑1 AACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGT < 1:1145053/135‑1 AACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGT < 2:4795/135‑1 AACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGT < 1:1459049/135‑1 AACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAA < 1:3359623/130‑1 ATCAAAGCTCGTGACTTTTACTAACGTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGGTGTCGT > 2:3336756/1‑135 CAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTAT < 1:3291839/135‑1 AAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCGGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATA < 2:1314439/135‑1 CTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGT > 2:3266651/1‑134 AGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAAC < 1:1437704/135‑1 AGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTA < 2:1650322/133‑1 AGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTA < 2:2554910/133‑1 TTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTTTAAAGAACAAAAGTTGTCGTATAAGTAACTTTGTTAT < 2:426859/135‑1 TTACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTAT < 1:1529088/135‑1 TACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATT < 2:348612/135‑1 TACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATT > 1:1706244/1‑135 ACTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTT < 2:2917352/135‑1 CTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTA > 2:2057345/1‑135 CTAACTTTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTA > 1:548148/1‑135 TTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCC > 2:1762061/1‑135 TTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATA < 2:2612357/112‑1 TTGATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATA > 1:2612357/1‑112 GATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAA > 2:2063084/1‑135 GATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAA > 1:472974/1‑135 GATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAA > 1:1471995/1‑135 GATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAA > 1:3027027/1‑135 GATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTT > 1:440145/1‑126 GATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTA < 1:2417846/114‑1 GATGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTA > 2:2417846/1‑114 TGTTTATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAA > 2:67860/1‑134 ACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTT < 2:699085/135‑1 ACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTT < 2:1990490/135‑1 ACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTT < 1:751168/135‑1 ACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCAAAAAAC < 2:3108410/125‑1 CTTATCAGTCCGATTTGACATAGAGCCAAGATTATTCATATTACTTGATAGTATTATCGTATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCTACAACCTACATTTTTG < 2:2983941/134‑1 CTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGA > 1:539089/1‑135 TTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAA > 2:3114770/1‑135 TTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAA > 1:1043541/1‑135 TTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAA > 1:3169982/1‑135 TTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTG > 1:2687577/1‑133 TTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTAT > 1:2682761/1‑92 ATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAAT > 1:3089229/1‑134 CAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGC > 2:835311/1‑135 CAGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGC < 2:139161/135‑1 AGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCC > 2:628912/1‑135 AGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCC > 1:2349544/1‑135 AGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAAT < 2:1166509/131‑1 AGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTT < 2:3284596/127‑1 AGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTT > 1:3284596/1‑127 AGTCCGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCG > 1:3211555/1‑84 CGATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATT < 1:2150517/134‑1 GATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGA > 2:2207958/1‑135 GATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGA > 1:3186073/1‑135 GATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGA > 1:902780/1‑135 GATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGA > 1:615634/1‑135 GATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGA > 2:2690536/1‑135 GATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTT > 2:1460313/1‑122 ATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATT > 1:584724/1‑132 ATTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTT > 1:3423148/1‑98 TTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACA > 1:2431473/1‑135 TTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACA > 1:1914838/1‑135 TTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAA < 2:2270468/86‑1 TTTGACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTT < 2:1960302/73‑1 GACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACATT > 1:2242428/1‑134 GACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGG > 2:547268/1‑99 ACAAAGAGCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACATTCA < 1:2207958/135‑1 GCCAAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACATTCACTAACTT > 1:2022764/1‑135 AAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACATTCACTAACTTT < 1:1224512/133‑1 AAGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACATTCACTAACTTT < 2:1884856/133‑1 CACCAATATGCGTTTGCGGATTTTTCTAATCAACGGGTTAATCAGCTACACATAAAAAAACATCAAAGCTAGTGACTTTTACTAACTTTGATGTTCATAGATGACCTTATCAGTCCGATTTGACAAAGAGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_30/198‑330‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGATTATTCAAATTACTGGAAAGTCTTATCGAATTAAAGATTATAAAGAAAAAAAGTTGTCGTATAAGTAACCTTGTTATTTATGGGCCAAAAACCTACATTTTTGAATGGCCATTGACATTCACTAACTTT < AssemblyC74_contig_36/1754‑1623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |