| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_43 | 1 = | 0 (0.000) | 328 (0.620) | 89/254 | 0.1 | 100% | coding (1215/1215 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_44 | = 1136 | 0 (0.000) | coding (1/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
CTTCCTGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_43/131‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTTTACAA < AssemblyC74_contig_44/1136‑1004 CTTCCTGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATT < 2:1982481/135‑1CTTCCTGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATT < 2:1702177/135‑1CTTCCTGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATT < 2:2897962/135‑1 TCCTGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTT < 1:3110238/134‑1 TCCTGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTT < 1:2246842/134‑1 TGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGAGTTAAGT > 1:1096907/1‑135 GTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTA < 2:2353330/135‑1 GTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGT > 2:2045904/1‑135 GTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGT > 2:296027/1‑135 TGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTT > 1:3445016/1‑135 TGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGT < 2:1343969/134‑1 ACGATCATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTG < 2:1312835/134‑1 ACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGG < 1:1014561/135‑1 ACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGG < 1:2369843/135‑1 ACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGG < 2:300063/135‑1 ACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTG < 1:2909769/134‑1 ACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTG < 1:2045904/134‑1 ACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTG < 1:1810962/134‑1 ACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTG < 2:565627/134‑1 ACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTG < 2:637174/134‑1 AACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGG < 2:799098/132‑1 ACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACA > 1:2850806/1‑135 CATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACAT < 1:1172242/135‑1 GGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTC < 2:2562838/135‑1 GATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCT > 1:354213/1‑135 GATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCT > 2:1853953/1‑135 GATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCT > 2:1722429/1‑135 GTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTG < 2:148199/135‑1 GTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCAC > 1:886287/1‑135 GTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCAC > 1:798675/1‑135 GTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGA > 2:1017860/1‑120 TTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACG < 1:2781656/135‑1 TTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACG < 2:886287/135‑1 TTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGG > 1:2120192/1‑116 TTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTG > 1:363940/1‑115 CAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATA > 1:440831/1‑135 AAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATAT > 1:2284833/1‑135 AAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATAT > 2:458907/1‑135 AAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTG < 2:2856279/125‑1 AAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGT > 1:3141226/1‑119 AAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGT < 2:3141226/119‑1 TTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAG < 1:698902/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTTGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGATTATGAGC < 2:2368069/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 2:2313722/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 2:1631570/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 2:969022/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 1:732723/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 1:1978726/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 1:1939778/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 1:493191/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 1:1853953/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 1:1722429/135‑1 TGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC < 1:3261172/135‑1 CAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTG > 1:997546/1‑116 ACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGT < 1:2386498/135‑1 AATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGT < 1:1511081/135‑1 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAAC > 1:2083294/1‑134 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAAC > 2:2481802/1‑134 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAAC > 2:2233678/1‑134 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAAC > 1:2554458/1‑134 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAAC > 1:2758624/1‑134 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAAC > 1:3326596/1‑134 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAAC > 2:1278099/1‑134 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTT > 1:2937761/1‑131 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATG < 1:1419486/111‑1 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGC > 1:299250/1‑105 AATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTG > 2:3169447/1‑77 TGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACG < 2:1112197/135‑1 GAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTT > 1:2516874/1‑135 TACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATT > 2:2449862/1‑135 ACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTT < 2:3506149/135‑1 ACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTT < 1:924363/135‑1 ACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATT < 2:1377931/134‑1 CCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTT > 2:1836246/1‑134 CCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACT > 2:3409840/1‑123 ACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCACTATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACT > 1:684570/1‑135 ACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACT > 1:2699498/1‑135 ACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACT > 1:1741096/1‑135 ACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTT > 2:2523341/1‑106 ACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAA > 2:2750995/1‑83 CTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTG < 1:1056544/135‑1 AGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGA < 1:137961/135‑1 AGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGA < 2:1213589/135‑1 GGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATG < 1:1365413/133‑1 CAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTG < 2:741177/134‑1 CAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTAAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTG < 2:370795/134‑1 AAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTG < 2:1741096/135‑1 AAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGAC < 1:1670992/135‑1 AAACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGAC > 2:1095323/1‑135 AACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACG < 2:211513/135‑1 ACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGA < 1:568881/135‑1 ACTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGA < 2:354213/135‑1 CTATACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAA < 1:2481802/135‑1 ACTGGGACAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTATTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAAATTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATt < 2:2770288/135‑2 CAACAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTA > 2:2683410/1‑135 CAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATG > 2:3418361/1‑125 CAGCTCCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATG < 1:3418361/125‑1 CCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTTTAC < 2:684570/134‑1 CCAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTTTAC < 2:923040/134‑1 CAGATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTTTACAA > 2:3075244/1‑135 CTTCCTGTGTGACGAACATGGATAGTATGTTTGCAAATTGTTCCAACTTGACGAATCTAGATGTAAGCAATTGGAAGCTACCTACTTCGTTAGCTGGAATGTTCAAAAACTATACTGGGACAACAGCTCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_43/131‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GATTTAAGTAGTTGGGACATGTCTAGTGTCACGAATATGAGCAATATGTTCAAGGGTTGTAGTAATTTAACTACGTTAAATTTGACTGGTTGGGATGTCACCTCTGTGACGAATATGAATAGTATGTTTACAA < AssemblyC74_contig_44/1136‑1004 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |