| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 328 total aligned reads displayed.
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acttaactcTGGAGCTGTTGTCCCAGTATAGTTTTTGAACATTCCAGCTAACGAAGTAGGTAGCTTCCAATTGCTTACATCTAGATTCGTCAAGTTGGAACAATTTGCAAACATACTATCCATGTTCGTcacaca > 1:1096907‑M1/10‑135 (MQ=255) aaatcTGGAGCTGTTGTCCCAGTATAGTTTTTGAACATTCCAGCTAACGAAGTAGGTAGCTTCCAATTGCTTACATCTAGATTCGTCAAGTTGGAACAATTTGCAAACATACTATCCATGTTCGTCACACAGGa < 1:2246842‑M1/129‑1 (MQ=255) aaatcTGGAGCTGTTGTCCCAGTATAGTTTTTGAACATTCCAGCTAACGAAGTAGGTAGCTTCCAATTGCTTACATCTAGATTCGTCAAGTTGGAACAATTTGCAAACATACTATCCATGTTCGTCACACAGGa < 1:3110238‑M1/129‑1 (MQ=255) aatcTGGAGCTGTTGTCCCAGTATAGTTTTTGAACATTCCAGCTAACGAAGTAGGTAGCTTCCAATTGCTTACATCTAGATTCGTCAAGTTGGAACAATTTGCAAACATACTATCCATGTTCGTCACACAGGAAg < 2:1702177‑M1/131‑1 (MQ=255) aatcTGGAGCTGTTGTCCCAGTATAGTTTTTGAACATTCCAGCTAACGAAGTAGGTAGCTTCCAATTGCTTACATCTAGATTCGTCAAGTTGGAACAATTTGCAAACATACTATCCATGTTCGTCACACAGGAAg < 2:1982481‑M1/131‑1 (MQ=255) aatcTGGAGCTGTTGTCCCAGTATAGTTTTTGAACATTCCAGCTAACGAAGTAGGTAGCTTCCAATTGCTTACATCTAGATTCGTCAAGTTGGAACAATTTGCAAACATACTATCCATGTTCGTCACACAGGAAg < 2:2897962‑M1/131‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGAGCTGTTGTCCCAGTATAGTTTTTGAACATTCCAGCTAACGAAGTAGGTAGCTTCCAATTGCTTACATCTAGATTCGTCAAGTTGGAACAATTTGCAAACATACTATCCATGTTCGTCACACAGGAAG > AssemblyC74_contig_43/1‑131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |