New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 397 total aligned reads displayed.
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TTGGGCGCGTTAATTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAG > 2:589685/1‑135 TTGGGCGCGTTAATTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAG < 2:122189/135‑1 TTGGGCGCGTTAATTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAG > 2:2967521/1‑135 TTGGGCGCGTTAATTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAG < 2:2673685/135‑1 TTGGGCGCGTTAATTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAG < 1:1778876/135‑1 GGGCGCGTTAATTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGC > 1:1036886/1‑134 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATTAAACGGGAAGTAGCTCAGCTTGGTAGAGCACTTGGTTTGGGACCAAGGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGTCTTCCCGATAATTATAAATTTAAACACGGGGCCTTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCT > AssemblyC74_contig_63/1‑133 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |