| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AssemblyC74_contig_1 | 377980 = | 9 (0.020) | 470 (1.290) | 91/254 | 0.1 | 79.8% | intergenic (+144/‑147) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Tyrosyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.1)/decarboxylase, putative |
| ? | AssemblyC74_contig_22 | = 4386 | 229 (0.700) | intergenic (‑126/‑12) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Transposase/hypothetical protein | |||||
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GTTTTTACCTTGAAAAAGGGAAATACTATTACAACATTCCAATTTTGAAACCCATCCTAAAATAGAACGCTGGTTGTCGTTAATACAATCTTTGCGAGGGAGTTTACATTTGTAAATTCCCTCGTTTTTTTTAATTATTTCAAAAGTGTGAACAATTCGGATAATTGATACATATTAAAATATGATTAAAAATCAGGCCAAAACTTAGTTTACAGAATAGAAGAACAGGTGTAATGTAGGGCTCGACAAAATTTAAATATTTTTTTA > AssemblyC74_contig_1/377847‑378113 | aagacatcttgattcctccttttgggttggttcgccaaattaattctaaaggatttcaaggtgtcttttctatatgttttggaaaataaaaaagatgctggtgtcatccaccaacatcaaaaagtatagagccat < 2:2682469‑M1/2‑1 (MQ=255) tttACCTTGAAAAAGGGAAATACTATTACAACATTCCAATTTTGAAACCCATCCTAAAATAGAACGCTGGTTGTCGTTAATACAATCTTTGCGAGGGAGTTTACATTTGTAAATTCCCTCGTTTTTTTTAattat > 1:1657343/1‑135 (MQ=255) tttACCTTGAAAAAGGGAAATACTATTACAACATTCCAATTTTGAAACCCATCCTAAAATAGAACGCTGGTTGTCGTTAATACAATCTTTGCGAGGGAGTTTACATTTGTAAATTCCCTCGTTTTTTTTAatta < 1:2177946/134‑1 (MQ=255) atcttgattcctccttttgggttggttcgccaaattaattctaaaggatttcaaggtgtcttttctatatgttttggaaaataaaaaagatgctggtgtcatccaccaacatcaaaaagtatagagccATTAttt < 1:1209839‑M1/7‑1 (MQ=255) 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GTTTTTACCTTGAAAAAGGGAAATACTATTACAACATTCCAATTTTGAAACCCATCCTAAAATAGAACGCTGGTTGTCGTTAATACAATCTTTGCGAGGGAGTTTACATTTGTAAATTCCCTCGTTTTTTTTAATTATTTCAAAAGTGTGAACAATTCGGATAATTGATACATATTAAAATATGATTAAAAATCAGGCCAAAACTTAGTTTACAGAATAGAAGAACAGGTGTAATGTAGGGCTCGACAAAATTTAAATATTTTTTTA > AssemblyC74_contig_1/377847‑378113 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |