| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_1 | 377980 = | 9 (0.020) | 470 (1.290) | 91/254 | 0.1 | 79.8% | intergenic (+144/‑147) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Tyrosyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.1)/decarboxylase, putative |
| ? | AssemblyC74_contig_22 | = 4386 | 229 (0.700) | intergenic (‑126/‑12) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Transposase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 703 total aligned reads displayed.
GTAAGACATCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCGATGTGATGCATTGAAATATAAAGATCATTTAAAGAAACATGAAGTAAAAGTCGATGATCGATGGGAGAATGCATTTCATAAAGCATATAATTCTAAAATAATCTATACAGTAGAAGATACGAATGAGCAAAAT > AssemblyC74_contig_22/4252‑4520 | gtAAGACATCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGcc > 1:2575138/1‑135 (MQ=255) aaGACATCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCat < 2:2487411‑M2/135‑3 (MQ=255) aaGACATCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCGa > 2:1280437/1‑135 (MQ=255) aaGACATCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCGa > 1:1823044/1‑135 (MQ=255) ctcTTGAGTCCTCCGTTTGGGGTGGTTCGACAAATTAATTCTTCCGGATTTCCAGGTGTCTTTTCTATATGTGTTGGAAAATATAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCattatt > 2:318774‑M2/2‑128 (MQ=255) aTCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCattattt < 1:1658265‑M2/135‑8 (MQ=255) aTCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCGATGTGa > 1:2270606/1‑135 (MQ=255) tCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCGATGTGAt < 1:45950/135‑1 (MQ=255) tCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCGATGTGAt < 1:158871/135‑1 (MQ=255) ttGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCattatttcaa < 1:3028731‑M2/135‑11 (MQ=255) 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ctTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCattatttcaaaagtgtgaac > 2:350353‑M2/1‑115 (MQ=255) tttGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCCAGGTGTCTTTTCTAAATGTTTTGGAAAAAAAAAAAGATGCTGGTGTCATCAACCAACATCAAAAAGTATATAGCCattattacaaaagtgtgaacaa < 2:2937994‑M2/135‑23 (MQ=255) tttGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCattatttcaaaagtgtgaacaa < 1:2413811‑M2/135‑23 (MQ=255) tttGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCGATGTGATGCATTGAAATATaa > 1:3213550/1‑135 (MQ=255) tGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCattatttcaaaagtgtgaacaatt > 1:659603‑M2/1‑111 (MQ=255) gggTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCattatttcaaaagtgtgaacaattc > 1:546245‑M2/1‑110 (MQ=255) 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GTAAGACATCTTGATTCCTCCTTTTGGGTTGGTTCGCCAAATTAATTCTAAAGGATTTCAAGGTGTCTTTTCTATATGTTTTGGAAAATAAAAAAGATGCTGGTGTCATCCACCAACATCAAAAAGTATAGAGCCGATGTGATGCATTGAAATATAAAGATCATTTAAAGAAACATGAAGTAAAAGTCGATGATCGATGGGAGAATGCATTTCATAAAGCATATAATTCTAAAATAATCTATACAGTAGAAGATACGAATGAGCAAAAT > AssemblyC74_contig_22/4252‑4520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |