| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_32 | 1 = | 0 (0.000) | 151 (0.540) +C |
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| ? | AssemblyC74_contig_40 | = 62 | NA (NA) | intergenic (–/+119) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Cold shock protein of CSP family | |||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGCAC > AssemblyC74_contig_32/1‑134 | acaccattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATAc > 1:125690‑M1/70‑135 (MQ=255)acaccattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATAc > 1:498735‑M1/70‑135 (MQ=255)acaccattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATAc > 1:1707629‑M1/70‑135 (MQ=255) accattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAAc < 1:234046‑M1/43‑1 (MQ=255) accattagaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAAc > 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gaagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCt < 1:389043‑M1/75‑1 (MQ=255) aagtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATATTTATTATTTTaa < 2:2761914‑M1/22‑1 (MQ=255) ttttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 2:1078100‑M1/58‑135 (MQ=255) gtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 2:2300896‑M1/58‑135 (MQ=255) gtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 2:310352‑M1/58‑135 (MQ=255) gtttttttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCtaat > 1:2669658‑M1/58‑135 (MQ=255) 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tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATg < 1:556213‑M1/82‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATg > 2:3153458‑M1/53‑134 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATg < 1:2711606‑M1/82‑1 (MQ=255) tttgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATg < 2:409974‑M1/82‑1 (MQ=255) tgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc > 1:3157510‑M1/51‑135 (MQ=255) tgagttacgtaaatggaaagttttgtctcgcttaatttgacaaataatagATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGc > 1:1317559‑M1/51‑135 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTAAAATAATTATTATTTTAATCAATAAAAACTTCTTTAAACATTTTCTTCAGAACCATTGATACTTCATTCCTAATAATGAGCATAATCTACTTTACTTTGTAGTTATAAAGCTTTTACATAAAATATGCAC > AssemblyC74_contig_32/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |