| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AssemblyC74_contig_43 | 992 = | 231 (0.660) | 560 (1.160) | 92/254 | 0.0 | 82.9% | coding (224/1215 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
| ? | AssemblyC74_contig_61 | = 423 | 0 (0.000) | intergenic (‑1/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– | |||||
Only 100 of 1218 total aligned reads displayed.
AGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTC > AssemblyC74_contig_43/859‑1126 | aaccttggaacatatcagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtcaaacactttgatctctttgtttgttcaag < 2:1050746‑M1/7‑4 (MQ=255) atggacgtaagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTcc > 2:273232‑M1/107‑132 (MQ=255) cGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCgg > 1:861083/1‑135 (MQ=255) taagaattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGaa > 1:36350‑M1/100‑135 (MQ=255) aattcatgtttgttacgtttgcagtatcaaaccctcgcatatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGc < 1:2300584‑M1/40‑1 (MQ=255) cagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCtt < 2:2072044‑M1/21‑1 (MQ=255) cagtcatatctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCtt < 2:2000507‑M1/21‑1 (MQ=255) cATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCa < 1:694143/134‑1 (MQ=255) tctgtaacattcgacatatcaaacccacgcatatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCt > 1:3198423‑M1/106‑135 (MQ=255) cGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCATTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCttt > 2:3083790/1‑135 (MQ=255) 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atatcgatggttgttactgtcttattatatgaaaaaaggtctttccaattagtgtctAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa < 2:574368‑M1/71‑1 (MQ=255) atatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa > 2:2335902‑M1/76‑125 (MQ=255) atatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGa > 1:2852058‑M1/76‑125 (MQ=255) atatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCttt < 2:3353030‑M1/60‑1 (MQ=255) atatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCttt < 2:2854487‑M1/60‑1 (MQ=255) atatCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGt > 1:3503683/1‑112 (MQ=255) atatCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCttt > 1:1816001/1‑135 (MQ=255) atatCAATGGTCTTGGCTTTTGAAGAAGTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCttt > 2:1455031/1‑135 (MQ=255) tatcgatggttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCttt > 1:2433343‑M1/75‑134 (MQ=255) gttgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATc > 2:2998528‑M1/67‑135 (MQ=255) tCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGAt > 2:853764/1‑133 (MQ=255) tgtaacttttgcatcgcggaaaagtccaaacaagttagtgtccaacactttgatctctttgtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCg > 2:236848‑M1/65‑134 (MQ=255) 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gtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAAATTGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGAACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:2773742‑M1/5‑135 (MQ=255) gtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAAATTGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGAACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 1:2493948‑M1/5‑135 (MQ=255) gtttGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAAATTGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGAACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:3246125‑M1/5‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 1:148548‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 1:2574666‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:2208351‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 1:2801286‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:123993‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 1:1663018‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:1403587‑M1/1‑135 (MQ=255) ATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCATTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGATACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGtt > 2:3302953‑M1/1‑135 (MQ=255) gTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTGCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTc < 1:3440258/135‑1 (MQ=255) | AGAGCAATAAGCGAACATGCTGTTCATATTCGTAACATTCGACGTATCAAACCCGCGCATATCAATGGTCTTTGCTTTTGAAGAATTGAAAAGATATGACCAGTCAGTATCCAACACTTTGATTTCTTTATTCGTTCCAGTGGCGGAAAAGCTTGTCAAGCCTTTTAAGTTCAAGGCATTAGACATTTCCTTTAGAGAGATCGCTACAGGTTTATTTTTGAAAGTGGTTGGTACTTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTC > AssemblyC74_contig_43/859‑1126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |