New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AssemblyC74_contig_43 | 992 = | 231 (0.660) | 560 (1.160) | 92/254 | 0.0 | 82.9% | coding (224/1215 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein |
? | AssemblyC74_contig_61 | = 423 | 0 (0.000) | intergenic (‑1/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
Only 100 of 563 total aligned reads displayed.
GAGCCACAACCTTGGAACATATCAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_61/289‑423 | aaCCTTGGAACATATCAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccag < 1:2935191‑M2/135‑8 (MQ=255) aaCCTTGGAACATATCAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccag < 1:1385471‑M2/135‑8 (MQ=255) aaCCTTGGAACATATCAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccag < 2:582167‑M2/135‑8 (MQ=255) aaCCTTGGAACATATCAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccag < 2:2340911‑M2/135‑8 (MQ=255) ttGGAACATATCAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggc > 1:2294549‑M2/1‑124 (MQ=255) aCATATCAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaa > 2:701249‑M2/1‑119 (MQ=255) cAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttg > 1:1515382‑M2/1‑113 (MQ=255) cAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttg > 2:2918368‑M2/1‑113 (MQ=255) cAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagctt < 1:3454001‑M2/134‑22 (MQ=255) cAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagctt < 2:2788463‑M2/134‑22 (MQ=255) cAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagctt < 2:2072044‑M2/134‑22 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgt < 1:1070648‑M2/135‑24 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgt < 1:2461479‑M2/135‑24 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgt < 1:302138‑M2/135‑24 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgt < 2:1861250‑M2/135‑24 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgt < 2:2522195‑M2/135‑24 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgt < 2:2997735‑M2/135‑24 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgt < 2:362471‑M2/135‑24 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgt < 2:7531‑M2/135‑24 (MQ=255) aGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttcc < 2:2416684‑M2/117‑6 (MQ=255) tatCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaa < 1:2419478‑M2/133‑27 (MQ=255) tCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagcct > 2:831756‑M2/1‑105 (MQ=255) tGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttt < 1:694602‑M2/135‑33 (MQ=255) tGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttt < 2:958090‑M2/135‑33 (MQ=255) tGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagcct > 1:1195629‑M2/1‑103 (MQ=255) tGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagcct < 2:1195629‑M2/133‑31 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 2:3434013‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 2:1779690‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 1:1789818‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 2:2472063‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 2:1517231‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 1:3241445‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 1:724023‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 1:2889904‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 1:2805240‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 1:1130457‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 1:2008566‑M2/1‑98 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaag < 1:2253959‑M2/134‑37 (MQ=255) cATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaag < 1:1581851‑M2/134‑37 (MQ=255) aTTCGACATATCAAACCTACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 2:2743051‑M2/1‑97 (MQ=255) aTTCGACATATCAAACCTACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt < 1:2743051‑M2/134‑38 (MQ=255) aTTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagtt < 1:1009289‑M2/135‑39 (MQ=255) aTTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagtt < 2:3372647‑M2/135‑39 (MQ=255) gACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaa < 2:2696913‑M2/134‑42 (MQ=255) gACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaa < 1:1695098‑M2/134‑42 (MQ=255) gACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaa < 1:2527522‑M2/134‑42 (MQ=255) gACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaa < 1:2358541‑M2/134‑42 (MQ=255) aCATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaagg > 1:2846781‑M2/1‑92 (MQ=255) aCATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaagg > 2:3467984‑M2/1‑92 (MQ=255) aCATATCAAACCCACGCAGATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaagg < 2:2001335‑M2/135‑44 (MQ=255) atatCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggca < 1:843085‑M2/135‑46 (MQ=255) aaaCCCCCGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattaga > 2:885448‑M2/1‑85 (MQ=255) aaaCCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattaga > 1:89261‑M2/1‑85 (MQ=255) aaaCCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattaga > 1:619284‑M2/1‑85 (MQ=255) aaaCCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattaga > 2:1428195‑M2/1‑85 (MQ=255) atatCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgccttt < 2:2441898‑M2/135‑61 (MQ=255) atatCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgccttt < 2:2625465‑M2/135‑61 (MQ=255) atatCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgccttt < 2:1712483‑M2/135‑61 (MQ=255) atatCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattaga < 2:2852058‑M2/125‑51 (MQ=255) tCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttaga > 2:1902561‑M2/1‑72 (MQ=255) gATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagaga < 2:222566‑M2/135‑66 (MQ=255) gATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggc < 2:1740522‑M2/114‑45 (MQ=255) tGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaa < 2:3256096‑M2/135‑68 (MQ=255) tGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcg > 2:236848‑M2/1‑64 (MQ=255) tGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaattg > 1:1752956‑M2/1‑64 (MQ=255) tAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgcta < 2:1609422‑M2/135‑74 (MQ=255) cATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGTTCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttat < 1:1256095‑M2/135‑83 (MQ=255) cATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttat < 1:477859‑M2/135‑83 (MQ=255) aTCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaattgctacaggtttatt < 2:1029672‑M2/135‑84 (MQ=255) aTCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaattgctacaggtttatt < 1:3513311‑M2/135‑84 (MQ=255) cgGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttg > 1:582167‑M2/1‑48 (MQ=255) cgGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttg > 1:1665557‑M2/1‑48 (MQ=255) cgGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttg > 1:3372647‑M2/1‑48 (MQ=255) aaaaGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaa < 2:3089468‑M2/135‑91 (MQ=255) aGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaattgctacaggtttatttttgaaagtg > 1:14486‑M2/1‑42 (MQ=255) aaaCAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttgg > 2:1385471‑M2/1‑37 (MQ=255) aCAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggta > 2:1481832‑M2/1‑35 (MQ=255) aCAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggta > 2:3218558‑M2/1‑35 (MQ=255) aGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggac < 1:2173962‑M2/135‑108 (MQ=255) aGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggac < 1:96890‑M2/135‑108 (MQ=255) aGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttgg > 2:646687‑M2/1‑28 (MQ=255) aGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttgg > 1:1841703‑M2/1‑28 (MQ=255) acacTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtct > 1:2696913‑M2/1‑20 (MQ=255) acacTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtct > 1:1609422‑M2/1‑20 (MQ=255) acacTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtct > 2:3324464‑M2/1‑20 (MQ=255) acTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattaga > 2:425561‑M2/1‑18 (MQ=255) cTTTGATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtcttat > 1:1890829‑M2/1‑17 (MQ=255) gATCTCTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtcttatcgcc < 1:406812‑M2/135‑123 (MQ=255) gATCTCTGTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtcttatcgcc < 2:2255884‑M2/135‑123 (MQ=255) tctcTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtcttatcgccgg < 1:1960148‑M2/135‑125 (MQ=255) tctcTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtcttat > 2:164536‑M2/1‑11 (MQ=255) tctcTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaattgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttgaacattggtcttatcgccgg < 1:3081686‑M2/135‑125 (MQ=255) tctcTTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaattgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttgaacattggtcttatcgccgg < 1:3167760‑M2/135‑125 (MQ=255) ctctTTGTTTgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaattgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttgaacattggtcttatcgccgg > 1:2581543‑M2/1‑10 (MQ=255) tgtttgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtcttatcgccggtatagt > 1:3314392‑M2/1‑5 (MQ=255) gtttgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtcttatcgccggtatagtt > 2:1070648‑M2/1‑4 (MQ=255) gtttgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtcttatcgccggtatagtt > 1:3407994‑M2/1‑4 (MQ=255) gtttgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagaaattgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttgaacattggtcttatcgccggtatagtt > 2:1270179‑M2/1‑4 (MQ=255) gtttgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagt > 1:2099990‑M2/1‑4 (MQ=255) tttgttccagtggcggaaaagcttgtcaagccttttaagttcaaggcattagacattgcctttagagagatcgctacaggtttatttttgaaagtggttggtacttggacattggtctta > 2:2929760‑M2/1‑3 (MQ=255) | GAGCCACAACCTTGGAACATATCAGTCATATCTGTAACATTCGACATATCAAACCCACGCATATCGATGGTTGTAACTTTTGCATCGCGGAAAAGTCCAAACAAGTTAGTGTCCAACACTTTGATCTCTTTGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_61/289‑423 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |