| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_43 | = 1217 | 0 (0.000) | 907 (1.760) | 80/246 | 0.2 | 73.7% | intergenic (‑2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_44 | 617 = | 647 (0.940) | coding (520/1134 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 913 total aligned reads displayed.
TTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_43/1093‑1217 | ttGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattcttt < 1:221945‑M1/135‑11 (MQ=255)ttGAACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattcttt < 2:3167760‑M1/135‑11 (MQ=255) gACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttt > 2:2631291‑M1/1‑122 (MQ=255) cATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttg > 2:1273570‑M1/1‑120 (MQ=255) cATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttg > 2:2765962‑M1/1‑120 (MQ=255) cATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttg > 2:1889327‑M1/1‑120 (MQ=255) cATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttg > 1:472019‑M1/1‑120 (MQ=255) cATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattcttt < 1:2405834‑M1/130‑11 (MQ=255) cATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattcttttttt < 1:2354930‑M1/134‑15 (MQ=255) cATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCGTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttg > 2:1182648‑M1/1‑120 (MQ=255) tGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcgg < 1:1731493‑M1/135‑19 (MQ=255) gTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcg < 2:3320016‑M1/132‑18 (MQ=255) ccGGTATAGTTCGTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCATGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatct < 2:2300809‑M1/135‑30 (MQ=255) ccGGTATAGTTCGTCAGCTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatct < 2:1357422‑M1/135‑30 (MQ=255) cGTCAGCTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttg < 1:2607375‑M1/133‑39 (MQ=255) gTCAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCAGCCCACTCACCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATAAGataattcttttatttcggttaaacaatctggtaatttgtc > 1:797627‑M1/1‑94 (MQ=255) gTCAGCTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtcc < 2:1648194‑M1/135‑42 (MQ=255) cAGCTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtc > 1:2742018‑M1/1‑92 (MQ=255) cTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgt > 2:1938156‑M1/1‑89 (MQ=255) cTTGTATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgt > 1:1793473‑M1/1‑89 (MQ=255) cTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgt > 1:3119440‑M1/1‑89 (MQ=255) cTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcat < 2:1455008‑M1/135‑58 (MQ=255) cTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcat < 2:406812‑M1/135‑58 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 1:2026075‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 1:2683544‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 1:1276671‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 2:696932‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 2:880599‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 1:970656‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 1:3169327‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 1:3334298‑M1/1‑76 (MQ=255) aaTTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatc > 2:200875‑M1/1‑76 (MQ=255) tGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatca < 2:472019‑M1/135‑63 (MQ=255) gATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatca > 2:1007612‑M1/1‑72 (MQ=255) gATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatca > 2:1485412‑M1/1‑72 (MQ=255) atcCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatctt < 2:2452794‑M1/135‑68 (MQ=255) atcCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatctt > 1:1053810‑M1/1‑68 (MQ=255) atcCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatctt < 1:371678‑M1/135‑68 (MQ=255) atcCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatctt < 1:1867705‑M1/135‑68 (MQ=255) atcCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatctt > 1:2452567‑M1/1‑68 (MQ=255) atcCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatctt > 1:1947264‑M1/1‑68 (MQ=255) cccACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatctt > 1:3422935‑M1/1‑66 (MQ=255) ccACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCTGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatc < 1:3533425‑M1/135‑71 (MQ=255) ccACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatc < 2:1229206‑M1/135‑71 (MQ=255) aCTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatctt < 1:2932281‑M1/135‑73 (MQ=255) ctcCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcg < 2:1396222‑M1/135‑76 (MQ=255) tCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcat < 1:653396‑M1/111‑58 (MQ=255) tCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattc > 1:1009836‑M1/1‑54 (MQ=255) tCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattc > 1:151515‑M1/1‑54 (MQ=255) ccAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattcc > 1:419060‑M1/1‑53 (MQ=255) ccAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattcc > 2:833494‑M1/1‑53 (MQ=255) ccAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattcc > 1:680922‑M1/1‑53 (MQ=255) ccAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttatt > 1:120977‑M1/1‑53 (MQ=255) ccAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcat > 1:2796028‑M1/1‑53 (MQ=255) ccAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattca > 2:3201093‑M1/1‑53 (MQ=255) ccAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatc < 1:1473136‑M1/123‑71 (MQ=255) cAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattcc < 2:1128314‑M1/134‑83 (MQ=255) aaTCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccat > 2:2235761‑M1/1‑51 (MQ=255) aaTCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccat > 1:1404893‑M1/1‑51 (MQ=255) aaTCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccat > 2:527232‑M1/1‑51 (MQ=255) aaTCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccat > 1:231735‑M1/1‑51 (MQ=255) aaTCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccat > 1:2509803‑M1/1‑51 (MQ=255) aaTCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcat < 2:740799‑M1/108‑58 (MQ=255) aaTCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccat > 2:2411628‑M1/1‑51 (MQ=255) aaTCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttt > 2:2710839‑M1/1‑51 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc > 2:1564798‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc > 2:1811099‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc > 1:727305‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc < 1:1162776‑M1/135‑90 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc > 1:880999‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc > 1:1661509‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc > 2:2925355‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc > 2:2534749‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatctttcgttattccatcattc > 1:1106149‑M1/1‑46 (MQ=255) ccTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattc > 2:1756049‑M1/1‑46 (MQ=255) ttCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattca < 2:927965‑M1/134‑91 (MQ=255) ttCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattcttttttggcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaa > 1:1357703‑M1/1‑44 (MQ=255) ttCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattca < 1:3206848‑M1/134‑91 (MQ=255) ttCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttg > 1:218733‑M1/1‑44 (MQ=255) aGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaa > 1:2854865‑M1/1‑41 (MQ=255) aGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaac > 2:3118111‑M1/1‑41 (MQ=255) aGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaa < 2:2325256‑M1/75‑35 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCACTTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg > 2:2183069‑M1/1‑33 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg < 2:3405749‑M1/135‑103 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg > 2:2095591‑M1/1‑33 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg < 1:3260797‑M1/135‑103 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg < 2:3542473‑M1/135‑103 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg < 2:1048697‑M1/135‑103 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg > 1:917662‑M1/1‑33 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg < 2:2825414‑M1/135‑103 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattcc < 2:2978474‑M1/115‑83 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggtgaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg < 2:636472‑M1/135‑103 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg < 2:3506383‑M1/135‑103 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg < 1:2987917‑M1/135‑103 (MQ=255) cAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatg > 2:3241210‑M1/1‑33 (MQ=255) aaaTAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcgc > 2:303621‑M1/1‑32 (MQ=255) aataatTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcg > 1:840955‑M1/1‑31 (MQ=255) tGCGCTTGTGCAATTAAATCCAataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcgcatcatcttta < 1:550492‑M1/135‑114 (MQ=255) cgcTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcgcatcatctttaaa < 1:1620738‑M1/135‑116 (MQ=255) cTTGTGCAATTAAATCCGataattctttttttgcggttaaactatctggtaatttgtccactgttttcttagcatcatcaatcttatcttgcgttattccatcattcaaaacggtatgcgcatcatctttaaac > 2:2581253‑M1/1‑18 (MQ=255) | TTGGACATTGGTCTTATCGCCGGTATAGTTCGTCAGCTTATATCTTCCTAATTGATCATCCCACTCTCCTGTCCAATCGCCTTCAGTTGTATCAAATAATTTTTGCGCTTGTGCAATTAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AssemblyC74_contig_43/1093‑1217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |