| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AssemblyC74_contig_33 | = 3075 | 0 (0.000) | 294 (0.620) | 93/254 | 0.1 | 100% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | hypothetical protein/– |
| ? | AssemblyC74_contig_4 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑2) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_si milarity | –/Phage lysin, N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase (EC 3.5.1.28) | |||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTGGTATTT > AssemblyC74_contig_4/1‑135 | ctgttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCt < 2:1527296‑M2/2‑1 (MQ=255) tgttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCtt > 1:3049135‑M2/133‑135 (MQ=255) tgttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCtt > 1:3285319‑M2/133‑135 (MQ=255) tgttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCtt > 2:1104810‑M2/133‑135 (MQ=255) gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt < 1:3409661‑M2/4‑1 (MQ=255) gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt < 1:486873‑M2/4‑1 (MQ=255) gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt < 1:2031919‑M2/4‑1 (MQ=255) gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCtt > 1:2481806‑M2/132‑134 (MQ=255) gttacgaatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCtt > 1:3021468‑M2/132‑134 (MQ=255) aatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt < 1:2047170‑M2/4‑1 (MQ=255) aatgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaacaacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGa > 1:2297349‑M2/126‑135 (MQ=255) tgtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGAt < 2:1735449‑M2/11‑1 (MQ=255) gtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt < 1:1012599‑M2/4‑1 (MQ=255) gtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGAtt > 2:643670‑M2/123‑134 (MQ=255) gtaggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGAt < 2:3174903‑M2/11‑1 (MQ=255) aggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATc > 2:422733‑M2/121‑135 (MQ=255) ggaacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATc > 1:1512788‑M2/120‑134 (MQ=255) aacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTAc > 2:3312146‑M2/118‑135 (MQ=255) aacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTAc > 1:3257611‑M2/118‑135 (MQ=255) aacatcatctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTAc > 2:897225‑M2/118‑135 (MQ=255) catctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTaaa > 2:572032‑M2/113‑135 (MQ=255) atctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTaaaa > 2:976508‑M2/112‑135 (MQ=255) atctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTaaaa > 1:1229319‑M2/112‑135 (MQ=255) ctgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAAt > 2:1056057‑M2/110‑135 (MQ=255) tgcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATg < 1:1047449‑M2/27‑1 (MQ=255) gcagctagatttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAAt > 2:2129033‑M2/108‑133 (MQ=255) ttaattttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAAtt < 1:806057‑M2/37‑1 (MQ=255) tttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGc > 2:1236608‑M2/93‑135 (MQ=255) tttgttttaccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaaaaacagcagtagcaacaacgacagcacatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGc > 1:2836229‑M2/93‑135 (MQ=255) ccaaagggagataaaggtgatccttgagaaaatgcgaaaactacagcagtagcaacaactacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCg < 2:3100350‑M2/52‑1 (MQ=255) ccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCg < 2:1606258‑M2/52‑1 (MQ=255) ccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCg < 1:1306675‑M2/52‑1 (MQ=255) ccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCg < 2:2132099‑M2/52‑1 (MQ=255) ccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCg < 1:1715809‑M2/52‑1 (MQ=255) ccaaagggagataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCg < 2:2396847‑M2/52‑1 (MQ=255) caaatgggagatacaggagatcctttagaaaatgcgacaactacagcagtatcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCg < 1:1873632‑M2/52‑1 (MQ=255) gataaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGa < 2:515548‑M2/60‑1 (MQ=255) aaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacatcagtagaaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAat < 2:2836229‑M2/62‑1 (MQ=255) aaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAatat < 1:422733‑M2/64‑1 (MQ=255) aaaggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAat < 1:2934088‑M2/62‑1 (MQ=255) aaaggtgatcctggagaaaatgcgacaaatacagcagtagcaacaacgacagcaattggtttgatttctaaCTTTGAATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTTAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAatat < 1:720288‑M2/64‑1 (MQ=255) ggtgatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCa < 2:1641996‑M2/67‑1 (MQ=255) gatcctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAAc < 1:3003831‑M2/69‑1 (MQ=255) cctggagaaaatgcgacaactacatcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTg < 1:914801‑M2/72‑1 (MQ=255) cctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTgg > 2:316206‑M2/63‑135 (MQ=255) cctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTg < 2:262166‑M2/72‑1 (MQ=255) cctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTg < 1:3103112‑M2/72‑1 (MQ=255) ctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCg < 1:3461540‑M2/52‑1 (MQ=255) ctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCa < 1:3240846‑M2/67‑1 (MQ=255) ctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGga > 2:352129‑M2/62‑135 (MQ=255) ctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGga > 2:2250372‑M2/62‑135 (MQ=255) ctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGga > 2:722995‑M2/62‑135 (MQ=255) ctggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGga > 2:2314705‑M2/62‑135 (MQ=255) tggagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGgag > 2:2753031‑M2/61‑135 (MQ=255) gagaaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGAt < 2:341720‑M2/77‑1 (MQ=255) aaaatgcgacaactacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTa > 1:754625‑M2/56‑135 (MQ=255) aaatgcgacaactacagcagtagcaccaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGTGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAg > 2:217679‑M2/55‑135 (MQ=255) actacagcagtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTgggg > 2:2530388‑M2/45‑135 (MQ=255) gtagcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTaaaaa < 2:3460673‑M2/97‑1 (MQ=255) gcaacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAgg < 1:2753031‑M2/100‑1 (MQ=255) caacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCttt > 1:175692‑M2/32‑35 (MQ=255) caacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAg > 1:2098950‑M2/32‑134 (MQ=255) caacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAg > 2:2999185‑M2/32‑134 (MQ=255) caacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGAGATTTGGGGTAAAAAAGGAAg > 1:2177779‑M2/32‑134 (MQ=255) aacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGt > 1:670498‑M2/31‑134 (MQ=255) aacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGt > 1:3131514‑M2/31‑134 (MQ=255) aacaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGt > 1:2653107‑M2/31‑134 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGgag < 2:2064155‑M2/75‑1 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGCGAGGTCGGGATTTGGGGTAAAGAAGGAAGTTc > 1:1001428‑M2/30‑135 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGtt < 2:754625‑M2/105‑1 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGtt < 2:1034460‑M2/105‑1 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGtt < 2:2486158‑M2/105‑1 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGt < 2:3030819‑M2/104‑1 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGt < 1:2250372‑M2/104‑1 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTc > 2:180300‑M2/30‑135 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTc > 1:1377779‑M2/30‑135 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTc > 1:1611879‑M2/30‑135 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTc < 1:572032‑M2/106‑1 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTc > 2:1371476‑M2/30‑135 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTc > 1:221478‑M2/30‑135 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTc > 2:1876136‑M2/30‑135 (MQ=255) acaacgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGGAAAAAAGGAAGTTc > 2:2007125‑M2/30‑135 (MQ=255) caacgacagcaaatggtttgatgtctaaCATTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTcc < 1:3521606‑M2/107‑1 (MQ=255) acgacagcaaatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGc > 2:2075620‑M2/27‑135 (MQ=255) aatgttttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAggg < 2:1465861‑M2/113‑1 (MQ=255) aatggtttgatgtctaaCTTTGCATGCTTATCGACTTAACAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAgg < 2:1001428‑M2/118‑1 (MQ=255) aatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAggg < 1:597703‑M2/113‑1 (MQ=255) aatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGc < 1:2426927‑M2/115‑1 (MQ=255) aatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGc < 1:2818660‑M2/115‑1 (MQ=255) aatggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGc < 2:391967‑M2/115‑1 (MQ=255) atggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGc < 1:2314705‑M2/119‑1 (MQ=255) atggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGc < 2:842466‑M2/119‑1 (MQ=255) tggtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCg > 2:2446238‑M2/16‑135 (MQ=255) gtttgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGt < 2:288944‑M2/122‑1 (MQ=255) tgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCa < 2:3244616‑M2/124‑1 (MQ=255) tgatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCa < 1:2368013‑M2/124‑1 (MQ=255) gatgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCa > 1:2586504‑M2/10‑133 (MQ=255) atgtctatCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCTCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCTACTTGGAGATGTAGTGATTTGGTGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATAc < 1:844920‑M2/127‑1 (MQ=255) atgtctaaCTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCa > 2:3071779‑M2/9‑132 (MQ=255) cTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTGGTAttt > 1:2126696/1‑135 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTGCATGATTATCTACTTAAAAATGGCTTTGAATTAATCGCAGAAAATCGAGAATGGAATATGCAACGTGGAGATGTAGTGATTTGGGGTAAAAAAGGAAGTTCCGCAGGGGCAGGCGGTCATACTGGTATTT > AssemblyC74_contig_4/1‑135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |