New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | AssemblyC74_contig_45 | = 1002 | 0 (0.000) | intergenic (‑96/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Integrase, catalytic region/– |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
ACGAGAATTTTACTTTTATGTTTCCTCCATCTGTAATATTCGTTGGGTCCACGGTCAACGAAGTGACATTACTGCTGATATCTCTGCCTGCATCCGCATAGACATGAACAGGAATCAGTGATGTTATATTAGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_11/134‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCCGTTTGTATAATTAAGCGAGACAAATAAAAAAGCCATTTATGTTACACTCAAATTGTAATACCCGCTAAAGCATACAAGGAGAGTGAACATAAATGACTTATACCCATCTTACACCAAACGAGCTTGTA < AssemblyC74_contig_45/1002‑871 TTTTACTTTTATGTTTCCTCCATCTGTAATATTCGTTGGGTCCACGGTCAACGAAGTGACATTACTGCTGATATCTCTGCCTGCATCCGCATAGACATGAACAGGAATCAGTGATGTTATATTAGTACGCCGTT < 2:2341065/134‑1 TACTTTTATGTTTCCTCCATCTGTAATATTCGTTGGGTCCACGGTCAACGAAGTGACATTACTGCTGATATCTCTGCCTGCATCCGCATAGACATGAACAGGAATCAGTGATGTTATATTAGTACGCCGTTTGTA < 2:2448730/135‑1 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TTAGTACGCCGTTTGTATAATTAAGCGAGACAAATAAAAAAGCCATTTATGTTACACTCAAATTGTAATACCCGCAAAAGCATACAAGGAGAGTGAACATAAATGACTTATACCCATCTTACACCAAACGAGCTT > 2:320629/1‑135 ACGAGAATTTTACTTTTATGTTTCCTCCATCTGTAATATTCGTTGGGTCCACGGTCAACGAAGTGACATTACTGCTGATATCTCTGCCTGCATCCGCATAGACATGAACAGGAATCAGTGATGTTATATTAGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AssemblyC74_contig_11/134‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCCGTTTGTATAATTAAGCGAGACAAATAAAAAAGCCATTTATGTTACACTCAAATTGTAATACCCGCTAAAGCATACAAGGAGAGTGAACATAAATGACTTATACCCATCTTACACCAAACGAGCTTGTA < AssemblyC74_contig_45/1002‑871 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |